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豬重要性狀的組學遺傳基礎與改良 版權信息
- ISBN：9787030741783
- 條形碼：9787030741783 ; 978-7-03-074178-3
- 裝幀：一般膠版紙
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>
豬重要性狀的組學遺傳基礎與改良 內容簡介
本書按不同性狀分別總結和闡述近年來該性狀遺傳基礎研究及其改良技術在國內外的近期新科研進展與改良成果及發展趨勢，包括豬形態性狀的遺傳基礎與改良、豬遺傳缺陷的遺傳與排除、豬的抗病力與免疫性狀的遺傳與育種、豬抗逆性的遺傳與育種、豬的行為性狀及其遺傳、豬繁殖性狀的遺傳基礎及改良、豬生長性狀的遺傳基礎及改良、豬胴體性狀的遺傳基礎及改良、豬肉質性狀的遺傳基礎及改良、基因組印記及豬的印記性狀、中國地方豬的保護、優異性狀的評估與相關基因的發掘。本書還對目前新技術和研究進展進行了拓展，對一些與性狀遺傳基礎研究及其遺傳改良領域相關的熱門專題進行討論。
豬重要性狀的組學遺傳基礎與改良 目錄
目錄
**篇 概述
**章家豬起源和重要性狀的遺傳改良 3
**節家豬 3
第二節性狀及其分類 7
參考文獻 11
第二章豬組學數據的解析與應用 13
**節組學數據的范疇 13
第二節組學數據分析的基本方法 17
第三節組學數據分析的新技術 22
第四節豬重要經濟性狀組學分析案例 26
參考文獻 30
第二篇 豬基因組遺傳評估與基因挖掘
第三章基因組選擇育種統計模型研究進展 35
**節基因組選擇概念的提出 35
第二節*佳線性無偏預測法估計育種值 36
第三節個體親緣關系矩陣的構建 37
第四節方差組分估計 40
第五節基因組選擇GBLUP的改進模型 42
第六節基因組選擇軟件HIBLUP的安裝及使用 44
參考文獻 50
第四章基因組選擇育種模型的評估及影響因素 52
**節基因組選擇育種模型的評估 52
第二節基因組選擇育種模型的影響因素 58
參考文獻 63
第五章豬高效基因組育種技術的創制與應用 65
**節生產性能測定和樣品采集 65
第二節核酸提取和基因分型 72
第三節估計基因組育種值和計算選擇指數 73
參考文獻 75
第六章全基因組關聯分析統計模型的研究進展 77
**節全基因組關聯分析的簡介 77
第二節全基因組關聯分析中的數據 78
第三節全基因組關聯分析的流程和模型發展 82
第四節全基因組關聯分析軟件rMVP的安裝使用 84
參考文獻 98
第七章豬基因組育種模擬及規劃 100
**節育種模擬及規劃的進展 100
第二節育種模擬及規劃的原理 102
第三節育種模擬及規劃軟件SIMER的安裝使用 110
參考文獻 129
第八章豬整合組學基因評分推薦體系構建 131
**節豬多組學整合現狀 131
第二節豬整合組學基因評分推薦體系的設計與構建 133
第三節豬整合組學知識庫ISwine的使用 143
參考文獻 151
第三篇 豬功能基因組研究進展
第九章豬的調控元件和三維基因組學研究進展 155
**節DNA調控元件 155
第二節多層次的基因組 158
第三節豬基因組功能調控元件注釋與三維基因組學研究 163
參考文獻 164
第十章豬表觀基因組學研究進展 168
**節表觀遺傳學相關概念、基本特征及研究內容 168
第二節表觀遺傳產生的分子遺傳機制 174
第三節豬重要性狀表觀遺傳機制的研究進展 180
參考文獻 191
第十一章豬轉錄組學研究進展 196
**節豬mRNA-seq研究進展 196
第二節豬miRNA組學研究進展 200
第三節豬lncRNA組學研究進展 203
第四節豬circRNA組學研究進展 207
第五節豬全轉錄分析研究進展 209
參考文獻 211
第十二章豬蛋白質組學研究進展 216
**節豬蛋白質組學的概述 216
第二節蛋白質組學在豬相關疾病中的研究進展 218
第三節蛋白質組學在豬營養調控中的研究進展 220
第四節蛋白質組學在豬生長發育中的研究進展 221
第五節蛋白質組學在豬肉品質中的研究進展 221
第六節蛋白質組學與豬繁殖性狀 222
第七節蛋白質組學在豬疾病模型中的研究進展 224
第八節蛋白質組學技術在豬中的應用展望 225
參考文獻 226
第十三章豬胚胎工程與基因修飾育種新技術 229
**節胚胎工程育種技術 229
第二節轉基因育種與轉基因克隆動物技術 233
第三節干細胞育種 241
參考文獻 244
第四篇 豬重要性狀的遺傳基礎
第十四章豬生長速度與飼料效率的遺傳改良 251
**節豬生長速度與飼料效率的度量及其遺傳特性 251
第二節豬生長速度與飼料效率的遺傳基礎研究 254
第三節豬生長性狀的遺傳改良 256
參考文獻 261
第十五章豬胴體性狀的遺傳基礎及改良 265
**節豬胴體性狀的遺傳特性 265
第二節豬胴體性狀的遺傳基礎研究 268
第三節豬肌肉生長速度與胴體組成性狀的遺傳改良 270
第四節豬背膘厚、眼肌面積與瘦肉率的遺傳改良 273
第五節上市肉豬的胴體評估與分級及其在推動生豬改良中的意義 277
參考文獻 278
第十六章豬繁殖性狀的遺傳基礎及改良 282
**節豬繁殖性狀的基本特征 282
第二節公豬繁殖性狀的遺傳基礎研究 284
第三節母豬繁殖性狀的遺傳基礎研究 290
第四節豬繁殖性狀的遺傳改良 293
參考文獻 297
第十七章豬的遺傳缺陷與改良 302
**節豬遺傳缺陷的定義 302
第二節豬主要遺傳缺陷及其危害 303
第三節豬遺傳缺陷的遺傳方式 312
第四節豬遺傳缺陷相關候選基因的鑒定 315
參考文獻 320
第十八章豬抗病抗逆與免疫性狀的遺傳基礎與改良 327
**節豬抗病力的概念與度量 327
第二節免疫性狀 335
第三節豬主要組織相容性復合體 339
第四節豬抗病抗逆與免疫性狀的遺傳改良 342
參考文獻 356
第十九章豬肉質性狀的遺傳基礎及改良 360
**節豬肉質的組分性狀及其度量 360
第二節豬應激綜合征與異常肉質 366
第三節豬肉質性狀的遺傳基礎研究 371
第四節豬肉質性狀的遺傳改良 377
參考文獻 381
第二十章豬的行為性狀及其遺傳 384
**節豬的行為性狀 384
第二節行為遺傳學 392
第三節豬遺傳改良中行為性狀及異常行為的改良 407
參考文獻 408
第五篇 豬遺傳改良的研究進展與展望
第二十一章豬基因組組裝研究進展 417
**節豬基因組計劃研究進展與組織 417
第二節豬基因組作圖 419
第三節豬基因組序列注釋新進展 426
參考文獻 429
第二十二章基因組選擇在豬雜交生產中的應用 432
**節雜交豬的基因型填充技術 432
第二節*大化純種豬的雜交效果表現 436
第三節非加性遺傳效應在雜種生產中的應用 444
參考文獻 447
第二十三章選擇信號檢測方法及其統計學問題 452
**節人工選擇作用下的基因組印記 452
第二節選擇信號的類別 453
第三節選擇信號檢驗統計量 454
第四節選擇信號的基因組數據模擬軟件與統計檢驗 459
第五節畜禽基因組選擇信號的可靠性驗證 461
第六節畜禽選擇信號檢測的影響因素與統計學問題 463
第七節機器學習在選擇信號上的應用 464
第八節展望 465
參考文獻 466
第二十四章基因組編輯技術在豬育種中的研究進展 470
**節基因編輯技術 470
第二節CRISPR/Cas9技術應用與編輯效率評估 473
第三節基于CRISPR系統的功能基因組學研究 478
第四節基因組編輯分子育種技術 485
參考文獻 489
第二十五章豬作為醫學動物模型的研究進展 495
**節用于人類醫學研究的小型豬品種及特點 496
第二節豬作為人類神經系統疾病模型的研究進展 500
第三節豬作為人類心血管疾病模型的研究進展 502
第四節豬作為人類 2型糖尿病模型的研究進展 504
第五節豬作為人類其他疾病模型的研究進展 511
參考文獻 515
第二十六章豬種質特色基因發掘與中國地方豬種資源保護利用 519
**節豬種質特色基因的發掘 519
第二節我國地方豬種資源概況 522
第三節中國地方豬遺傳資源的開發利用現狀 526
參考文獻 530
第二十七章豬的福利與育種 534
**節動物福利的概念與豬福利涵蓋的內容 534
第二節對動物福利的科學評價 535
第三節國外關于動物福利的立法與標準 540
第四節福利與動物健康和性能表現 542
第五節豬的福利與育種目標、選種措施 545
參考文獻 546
**篇 概述
**章家豬起源和重要性狀的遺傳改良 3
**節家豬 3
第二節性狀及其分類 7
參考文獻 11
第二章豬組學數據的解析與應用 13
**節組學數據的范疇 13
第二節組學數據分析的基本方法 17
第三節組學數據分析的新技術 22
第四節豬重要經濟性狀組學分析案例 26
參考文獻 30
第二篇 豬基因組遺傳評估與基因挖掘
第三章基因組選擇育種統計模型研究進展 35
**節基因組選擇概念的提出 35
第二節*佳線性無偏預測法估計育種值 36
第三節個體親緣關系矩陣的構建 37
第四節方差組分估計 40
第五節基因組選擇GBLUP的改進模型 42
第六節基因組選擇軟件HIBLUP的安裝及使用 44
參考文獻 50
第四章基因組選擇育種模型的評估及影響因素 52
**節基因組選擇育種模型的評估 52
第二節基因組選擇育種模型的影響因素 58
參考文獻 63
第五章豬高效基因組育種技術的創制與應用 65
**節生產性能測定和樣品采集 65
第二節核酸提取和基因分型 72
第三節估計基因組育種值和計算選擇指數 73
參考文獻 75
第六章全基因組關聯分析統計模型的研究進展 77
**節全基因組關聯分析的簡介 77
第二節全基因組關聯分析中的數據 78
第三節全基因組關聯分析的流程和模型發展 82
第四節全基因組關聯分析軟件rMVP的安裝使用 84
參考文獻 98
第七章豬基因組育種模擬及規劃 100
**節育種模擬及規劃的進展 100
第二節育種模擬及規劃的原理 102
第三節育種模擬及規劃軟件SIMER的安裝使用 110
參考文獻 129
第八章豬整合組學基因評分推薦體系構建 131
**節豬多組學整合現狀 131
第二節豬整合組學基因評分推薦體系的設計與構建 133
第三節豬整合組學知識庫ISwine的使用 143
參考文獻 151
第三篇 豬功能基因組研究進展
第九章豬的調控元件和三維基因組學研究進展 155
**節DNA調控元件 155
第二節多層次的基因組 158
第三節豬基因組功能調控元件注釋與三維基因組學研究 163
參考文獻 164
第十章豬表觀基因組學研究進展 168
**節表觀遺傳學相關概念、基本特征及研究內容 168
第二節表觀遺傳產生的分子遺傳機制 174
第三節豬重要性狀表觀遺傳機制的研究進展 180
參考文獻 191
第十一章豬轉錄組學研究進展 196
**節豬mRNA-seq研究進展 196
第二節豬miRNA組學研究進展 200
第三節豬lncRNA組學研究進展 203
第四節豬circRNA組學研究進展 207
第五節豬全轉錄分析研究進展 209
參考文獻 211
第十二章豬蛋白質組學研究進展 216
**節豬蛋白質組學的概述 216
第二節蛋白質組學在豬相關疾病中的研究進展 218
第三節蛋白質組學在豬營養調控中的研究進展 220
第四節蛋白質組學在豬生長發育中的研究進展 221
第五節蛋白質組學在豬肉品質中的研究進展 221
第六節蛋白質組學與豬繁殖性狀 222
第七節蛋白質組學在豬疾病模型中的研究進展 224
第八節蛋白質組學技術在豬中的應用展望 225
參考文獻 226
第十三章豬胚胎工程與基因修飾育種新技術 229
**節胚胎工程育種技術 229
第二節轉基因育種與轉基因克隆動物技術 233
第三節干細胞育種 241
參考文獻 244
第四篇 豬重要性狀的遺傳基礎
第十四章豬生長速度與飼料效率的遺傳改良 251
**節豬生長速度與飼料效率的度量及其遺傳特性 251
第二節豬生長速度與飼料效率的遺傳基礎研究 254
第三節豬生長性狀的遺傳改良 256
參考文獻 261
第十五章豬胴體性狀的遺傳基礎及改良 265
**節豬胴體性狀的遺傳特性 265
第二節豬胴體性狀的遺傳基礎研究 268
第三節豬肌肉生長速度與胴體組成性狀的遺傳改良 270
第四節豬背膘厚、眼肌面積與瘦肉率的遺傳改良 273
第五節上市肉豬的胴體評估與分級及其在推動生豬改良中的意義 277
參考文獻 278
第十六章豬繁殖性狀的遺傳基礎及改良 282
**節豬繁殖性狀的基本特征 282
第二節公豬繁殖性狀的遺傳基礎研究 284
第三節母豬繁殖性狀的遺傳基礎研究 290
第四節豬繁殖性狀的遺傳改良 293
參考文獻 297
第十七章豬的遺傳缺陷與改良 302
**節豬遺傳缺陷的定義 302
第二節豬主要遺傳缺陷及其危害 303
第三節豬遺傳缺陷的遺傳方式 312
第四節豬遺傳缺陷相關候選基因的鑒定 315
參考文獻 320
第十八章豬抗病抗逆與免疫性狀的遺傳基礎與改良 327
**節豬抗病力的概念與度量 327
第二節免疫性狀 335
第三節豬主要組織相容性復合體 339
第四節豬抗病抗逆與免疫性狀的遺傳改良 342
參考文獻 356
第十九章豬肉質性狀的遺傳基礎及改良 360
**節豬肉質的組分性狀及其度量 360
第二節豬應激綜合征與異常肉質 366
第三節豬肉質性狀的遺傳基礎研究 371
第四節豬肉質性狀的遺傳改良 377
參考文獻 381
第二十章豬的行為性狀及其遺傳 384
**節豬的行為性狀 384
第二節行為遺傳學 392
第三節豬遺傳改良中行為性狀及異常行為的改良 407
參考文獻 408
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第二十一章豬基因組組裝研究進展 417
**節豬基因組計劃研究進展與組織 417
第二節豬基因組作圖 419
第三節豬基因組序列注釋新進展 426
參考文獻 429
第二十二章基因組選擇在豬雜交生產中的應用 432
**節雜交豬的基因型填充技術 432
第二節*大化純種豬的雜交效果表現 436
第三節非加性遺傳效應在雜種生產中的應用 444
參考文獻 447
第二十三章選擇信號檢測方法及其統計學問題 452
**節人工選擇作用下的基因組印記 452
第二節選擇信號的類別 453
第三節選擇信號檢驗統計量 454
第四節選擇信號的基因組數據模擬軟件與統計檢驗 459
第五節畜禽基因組選擇信號的可靠性驗證 461
第六節畜禽選擇信號檢測的影響因素與統計學問題 463
第七節機器學習在選擇信號上的應用 464
第八節展望 465
參考文獻 466
第二十四章基因組編輯技術在豬育種中的研究進展 470
**節基因編輯技術 470
第二節CRISPR/Cas9技術應用與編輯效率評估 473
第三節基于CRISPR系統的功能基因組學研究 478
第四節基因組編輯分子育種技術 485
參考文獻 489
第二十五章豬作為醫學動物模型的研究進展 495
**節用于人類醫學研究的小型豬品種及特點 496
第二節豬作為人類神經系統疾病模型的研究進展 500
第三節豬作為人類心血管疾病模型的研究進展 502
第四節豬作為人類 2型糖尿病模型的研究進展 504
第五節豬作為人類其他疾病模型的研究進展 511
參考文獻 515
第二十六章豬種質特色基因發掘與中國地方豬種資源保護利用 519
**節豬種質特色基因的發掘 519
第二節我國地方豬種資源概況 522
第三節中國地方豬遺傳資源的開發利用現狀 526
參考文獻 530
第二十七章豬的福利與育種 534
**節動物福利的概念與豬福利涵蓋的內容 534
第二節對動物福利的科學評價 535
第三節國外關于動物福利的立法與標準 540
第四節福利與動物健康和性能表現 542
第五節豬的福利與育種目標、選種措施 545
參考文獻 546
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豬重要性狀的組學遺傳基礎與改良 節選
**篇 概述 **章家豬起源和重要性狀的遺傳改良 **節家豬 一、家豬在生物分類學上的地位 關于豬的生物學分類及演化起源，動物學家和考古學家在各階元的系統關系及分化時間上均有深入研究。家豬屬于哺乳綱（Mammalia），這一點毫無爭議，但是在豬的目級（order）分類單元名稱歸屬上，傳統的形態學、考古學與20世紀下半葉興盛的分子遺傳學證據很不一致。豬過去一直被歸于偶蹄目（Artiodactyla），但隨著分子遺傳學的發展，學者陸續發現鯨目（Cetacea）位于偶蹄目之內，于是學術界開始質疑傳統的偶蹄目作為完整單系群的分類地位是否合適（Gatesy and Dial，1996；Irwin et al.，1991）。有學者基于線粒體和12S序列，提出一個新目——鯨偶蹄目（Cetartiodactyla），即包含了之前的偶蹄目與鯨目，來解決偶蹄目并非單系群的問題（Montgelard et al.，1997），偶蹄目被降低為次級分類單元。后來的形態學和分子遺傳學手段進一步支持了鯨偶蹄目高于偶蹄目的觀點（Boisserie et al.，2005）。至此，豬屬于鯨偶蹄目的進化地位得以確定，與其演化關系比較近的動物如牛、羊、駱駝、河馬、海豚、鯨等的關系也更加明確。近年來，分子和化石證據表明，鯨偶蹄目的分化晚于靈長目（Primates，71～84Ma），但是早于食肉目（Carnivora，54～63Ma）。鯨偶蹄目分化時間為65～70Ma（Meredith et al.，2011），或者更早至80Ma左右（Zhou et al.，2011），該時間節點位于白堊紀 -古近紀的生物大滅絕（Cretaceous-Paleogene extinction event，K-Pg）期間或附近，與眾多哺乳動物目級分類單元的集中分化時期重疊，說明豬的目級祖先分化與古老地質歷史事件有著重要關聯。 在科級（family）分類單元上，豬的分類地位也非常特殊。豬科（Suidae）相對于其他科進化起源非常原始，位于鯨偶蹄目的基部位置，僅次于駱駝科（Camelidae）（Rubes et al.，2011），并與其于65Ma左右分開（Meredith et al.，2011）。豬科的昀近緣現存科為西貒科（Tayassuidae）（Rothschild and Ruvinsky，2011）。西貒科俗稱臭鼬豬或貒豬，昀早化石發現于泰國和中國，年代為37Ma左右，但目前現存種僅見于新大陸地區（北美西南部、中南美洲），該科下僅有3個單型屬，關系較為明確。相比之下，豬科則類目繁盛、分布廣泛，至今種間關系尚未完全厘清。豬科晚于始新世（Eocene Epoch），距今30Ma左右，形態學研究認為豬科的分化晚于西貒科。豬科現存兩個亞科：鹿豚亞科（Babyrousinae）和豬亞科（Suinae）。鹿豚亞科在中新世中期分離出來，并形成了蘇拉威西島特有的古老世系（Frantz et al.，2016）。隨著晚中新世全球變冷，在化石記錄中出現了豬亞科，其在當時幾乎取代了豬科下所有的其他亞科（Liu et al.，2019），F存的鹿豚亞科是單型屬，有3個種，分布于印度尼西亞。相比之下，豬亞科則繁盛得多，共有3個屬，包含15或16個已識別的種，這些種多數分布于東南亞，其他的廣泛分布于歐亞大陸，部分種僅存于非洲。 目前發現的昀早的豬屬（Sus）化石來自晚中新世（6～5.3Ma）的歐洲，鑒于該化石群體起源于亞洲，所以豬屬的分化時間可能早至上新世（Groves and Grubb，1993）。東南亞諸島（ISEA）上新世早期 /中期（約4.1Ma）演化出若干豬種。在更新世早期之前，歐亞大陸的物種多樣性可能一直保持在相對較高的水平，直到野豬從東亞擴散到世界各個角落。該擴張與晚更新世時期人類的大規模擴張相吻合。此前的研究表明，這也是歐亞大陸上大多數豬科物種消失的原因，并奠定了現代豬種的地理分布格局（Liu et al.，2019）（圖1-1）。目前豬屬包含10種（Groves and Grubb，2011），分別為：歐亞野豬 Sus scrofa（Eurasian wild boar）、爪哇野豬 Sus verrucosus（Javan pig）、婆羅洲須豬 Sus barbatus（bearded pig）、蘇拉威西島野豬 Sus celebensis（Sulawesi warty pig）、菲律賓野豬 Sus philippensis（Philippine warty pig）、米沙鄢野豬 Sus cebifrons（Visayan warty pig）、巴拉望須豬 Sus ahoenobarbus、印支野豬 Sus bucculentus、霍氏野豬 Sus heureni、民都洛疣豬 Sus oliveri。在種內多樣性方面，豬的10個種內亞種數目不一，總共大約22個亞種（Groves and Grubb，1993）。其中，歐亞野豬是唯一從眾多豬種中被成功馴化的種。豬屬內各種地理分布廣泛，各亞種分布存在差異，且缺乏系統的分子或者形態學分析，尚不明確亞種的準確個數和進化地位，有待全球學者進一步研究論證。 二、家豬的起源、馴化史與豬文化 目前認為，東亞和歐洲家豬獨立起源于不同的馴化事件。歐亞野豬祖先群體擴散至亞歐大陸到被人類馴化，中間經歷了數百萬年的時間，且進化歷史非常復雜。遺傳學及化石證據表明，歐亞野豬的祖先自上新世（5.3～3.5Ma）的東南亞分化而來（Groenen et al.，2012）。野豬具有生存力強（幾乎能生存于所有野外棲息地，適應環境溫度范圍為 –50～50℃）、生產能力強、食性廣、會游泳、群體活動等優良特點，使得種群能迅速從東南亞擴散至亞歐大陸，同時在海平面降低的時期通過陸橋擴散到各島嶼如中國臺灣蘭嶼、日本等（Larson et al.，2010）。目前發現的化石證據表明早更新世（約0.78Ma）的歐洲和中國（Rothschild and Ruvinsky，2011）已經存在歐亞野豬。事實上，亞洲野豬自然擴散到歐洲的時間可能更早。通過豬全基因組分析發現，歐亞野豬的深度遺傳分歧時間超過1Ma（Groenen et al.，2012），說明了歐亞野豬群體之間古老而持久的遷徙活動和基因交流。核基因分析發現，中國南方野豬與東南亞野豬有較近的親緣關系，中國北方豬與歐洲野豬有更近的親緣關系（Ai et al.，2015），這可能暗示了豬由起源地往北再往西的自然遷徙路線。豬較強的遷徙能力及適應性導致各地區豬種頻繁地基因交流，但是長時間的地理隔離也造成了遺傳分隔。各地區的豬遺傳多樣性也有所差異。線粒體基因組和全基因組分析均顯示亞洲野豬的遺傳多樣性要明顯高于歐洲野豬，其主要原因在于亞洲是野豬的起源中心，是歐洲野豬基因庫的來源，所以保存了更多的單倍型。不同地區的豬在形態學、遺傳學、生態和行為等方面有較大差異，因此歐亞野豬也存在復雜的亞種分類。僅就我國的歐亞野豬而言，就有7個亞種（Smith et al.，2009；王應祥，2003）：①喜馬拉雅亞種 S. s. cristatus Wagner，1839，分布于西藏南部和東南部；②新疆亞種S. s. nigripes Blanford，1875，分布于新疆（天山）；③東北亞種 S. s. ussuricus Heude，1888，分布于黑龍江、吉林、內蒙古東部（大興安嶺）；④臺灣亞種 S. s. taivanus Swinhoe，1863，分布于臺灣；⑤江北亞種 S. s. mouupinensis Milne-Edwards，1871，分布于長江與黃河之間的四川、青海、甘肅、寧夏、湖北、河南、山東、江蘇、安徽；⑥華南亞種 S. s. chiodontus Heude，1888，分布于長江以南各地區，包括江蘇、安徽、上海、福建、廣東、廣西、湖南、湖北、重慶、貴州、浙江和江西；⑦印支亞種 S. s. taininensis Heude，1888，分布于云南南部、西南部、西部和中部無量山區、哀牢山區。由于靠近歐亞野豬的起源地，且南北山川地貌氣候差異巨大，我國大部分地區保留了異常豐富的豬亞種資源，如何保護和開發我國現有歐亞野豬資源顯得非常重要。 現存豬分布范圍覆蓋歐洲和亞洲的大部分地區，這一分布格局一方面源于豬的自然種群歷史動態變化，同時又因為人類的干擾而變得錯綜復雜。根據豬被人類馴化的強弱，可以將其分為4種型：家豬、馴化的半野豬、野化豬和野豬（Massei and Genov，2004）。它們都可以追溯到一個共同祖先，并且可以互相交配產生可育后代。雖說如此，各地方的馴化豬往往是野豬就地馴化的結果（Larson et al.，2005）。一般來說，在古代商業活動相對受限的地形復雜的地區，本地現存豬種更多保留了本地野豬的基因庫，所以研究發現歐洲和亞洲的本地品種豬主要來自附近的馴化中心，雖然馴化后可能因為選育的需要而引入了其他地方豬種的血緣（Giuffra et al.，2000）。目前豬可能的馴化中心有9個，散布于歐亞大陸（Rothschild and Ruvinsky，2011）。而在一些缺乏歐亞野豬自然分布的地區，像大洋洲和新大陸地區，現存豬主要來自人類殖民時代的引入。例如，哥倫布第二次航行為新世界帶來了**批豬（Burgos-Paz et al.，2013）。另外，在18世紀到19世紀早期，亞洲豬也因為選育需要而被進口到歐洲。另外，在古代一些文明中心，也不乏人為因素導致的各地方豬的基因交流。古 DNA研究證明了在更久遠的歷史文化時期如黃銅時代（約公元前1150年）的以色列豬擁有近東地區的單倍型，但是鐵器時代（約公元前900年）由于歐洲豬隨人類早期航海者遷徙至以色列地區，本地豬與外來歐洲豬經過長期的基因交流，本地豬的基因組至今保存著更多的歐洲單倍型而非過去的近東單倍型（Meiri et al.，2013）。這說明在某些人類活動頻繁的地區，現存豬分布格局很可能受到過去人類活動的影響，而不易保存過去的原始單倍型；诖笠幠５娜蚪M重測序，也證實了豬在過去擴張和馴化的過程中發生了廣泛的基因交流（Ai et al.，2015）。雖然全球各地的馴化豬均直接來自野豬，但是馴化豬和野豬在形態和分子層面卻存在巨大差異，相對野豬其存在一些“馴化綜合征（domestication syndrome）”（Wilkins et al.，2014），例如，馴化豬的腦容量平均比野豬小35%，性情溫和，毛色、耳朵、吻突等形態學有明顯變化，這些變化是人類馴化選擇的直接后果。Frantz等（2015）也認為，家養性狀的反復選擇可能抵消了野豬基因流的同質化效應，并在基因組中形成了“馴化島”。 豬有很多適合馴化的優良條件，如活動范圍與人類一致、食性雜、產仔數多等，這給人類馴化野豬帶來便利？脊庞涗洶l現，昀早馴化豬的骨骼發現于距今9000年左右的近東土耳其地區（Ervynck et al.，2001）。利用同位素分析古代動物食性也發現了中國地區早期的馴化豬，如分析發現舞陽賈湖遺址存在距今9000年左右的家豬骨骼（羅運兵和張居中，2008）。距今10000年左右的河北徐水南莊頭遺址也出土了家豬的遺骸。從人類學角度來說，豬的馴化是人類從狩獵采集向農業生活轉變過程中的一個巨大技術進步。人類對野豬的馴化可能是一個逐步試驗和解決危機的過程（Redding，2005）。在新石器時代農業社會早期（距今13000～9000年），人類為了補充日常食物的不足，開始有意或無意地利用母豬生產肉食。首先人類為母豬提供額外的剩余食物或生活垃圾，使得母豬對人類產生了依賴，并允許它們與野外公豬自然交配，產生的后代中公豬被人類當作主要肉食來源，母豬被留下來進一步繁殖馴化，這樣就有了穩定的肉食來源。但是野外公豬與人類食性相似，在早期農業時代可能因為毀壞人類種植的谷物而被人類大規；蚨ㄆ卺鳙C。為了同時保證穩定的
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