1�wՓ
1.1�F�����＼�g��Փ1
1.1.1�F�����＼�g�Ļ��A֪�R1
1.1.2�F�����＼�g�İlչ�v��1
1.2�F���h�����＼�g��Փ3
1.2.1�F���h�����＼�g�Ļ��A֪�R3
1.2.2�F���h�����＼�g�đ���3
˼���}6

2ø����
2.1����7
2.1.1ø�İlչ�vʷ�c����7
2.1.2ø���̵İlչ�śr8
2.2ø�ķ������ԭ��10
2.2.1ø�ķ���c����10
2.2.2 ø������ԭ��12
2.3ø�ٷ��������W17
2.3.1���Ϸ���17
2.3.2ø�ٷ�����Ӱ�����20
2.4ø�����a�c���x����26
2.4.1ø�����a26
2.4.2ø�ķ��x����28
2.5ø�������40
2.5.1ø������Ļ��A֪�R41
2.5.2ø������Ļ���Ҫ���ԭ�t42
2.5.3ø���ӵ������43
2.5.4ø�������|׃��50
2.5.5����ø����52
2.5.6ø�Ķ����M��55
2.6ø�̶���57
2.6.1ø�̶����ķ���57
2.6.2�̶���ø�����l����׃��59
2.6.3�̶���ø������64
2.6.4�̶���ø�đ���66
2.7ø������69
2.7.1ø�������ĸ����Ҫ��69
2.7.2ø�����������69
2.7.3ø���������x��73
2.7.4ø���������OӋ76
2.7.5ø�������IJ���79
2.8ø�ڭh�����o�еđ���82
2.8.1ø�ڭh���O�y����đ���82
2.8.2ø�ڏUˮ̎������đ���83
2.8.3ø�ڿ����ｵ������I��đ���84
˼���}84

3���򹤳�
3.1����86
3.1.1���򹤳̵ķ�������W���A86
3.1.2DNA�ĽY���c����88
3.1.3DNA����89
3.1.4RNA�ĽY���c����91
3.2DNA׃�ԡ������c�s��93
3.2.1DNA׃��93
3.2.2DNA���ӏ���95
3.2.3DNA�����s��95
3.3���򹤳̹���ø95
3.3.1�����ԃ���ø96
3.3.2�B��ø98
3.3.3���ø99
3.4���򹤳��d�w100
3.4.1���x��������c100
3.4.2����ԭ�������������d�w101
3.4.3������������������d�w105
3.4.4����ֲ���������d�w108
3.4.5���ڄ����������d�w109
3.5Ŀ�Ļ���ī@��111
3.5.1����ĽM�ɼ����111
3.5.2ԭ���������ĽM��111
3.5.3����������ĽM��112
3.5.4��������M����ĽM��112
3.5.5ԭ������Ŀ�Ļ���ī@��113
3.5.6�������Ŀ�Ļ���ī@��114
3.6Ŀ�Ļ���Č���119
3.6.1���w����������119
3.6.2Ŀ�Ļ��������w����121
3.7�ؽM�w�ĺY�x123
3.7.1����W�����Y�x123
3.7.2���ߌW�����Y�x124
3.7.3��������s�����Y�x125
3.7.4ӡ�E���g125
3.8DNA�����128
3.8.1���W���ⷨ128
3.8.2�pÓ��朽Kֹ��129
˼���}131

4���}
4.1����һ����������W���������ăx��134
4.2΢����ķ�������W�b������136
4.2.1PCR���g136
4.2.2����PCR�ķ�������W����136
4.2.3���漰PCR�ķ�������W����138
4.2.4չ��139
4.3PCR�����OӋ139
4.3.1�����OӋ�Ļ���ԭ��140
4.3.2�OӋ������S��ԭ�t142
4.3.3�����OӋܛ������144
4.3.4RT-PCR�����OӋ152
4.3.5���������OӋ�^�̺�ԭ�t154
4.4���ͭh����Ⱦ���ޏͻ��򹤳̾��Ę���������155
4.4.1���򹤳̾������Ļ���ԭ��155
4.4.2���Ϻ�����155
4.4.3�������E156
˼���}157

5���
5.1�������࿂DNA����ȡ158
5.2�|��DNA���x�����c�b��159
5.3���ܑB�������Ƃ估�������D��163
5.4����16S rDNA����������ͬ��Ⱦ������΢����NȺ��׃��165
5.5�������࿂DNA��16S rDNA-PCR�U�����169
5.6DNA��֬�����z�Ӿ172
5.7�۱�ϩ�������z��DNA�Ļ��ա��y��ϵ�y�l����Ę���174
5.8ø�Ĺ̶���176
5.9���������Ó��ø���Ԝy��180
5.10�ЙC��Ⱦ���΢���ｵ�⡪����ЧÓ�Ӿ��ķ��x�ͺY�x182
5.11Biolog���yԇ����΢���������184
5.12PLFA�y��������Ⱥ���186
5.13DGGE��������������΢���������189
5.14����̶������zС�򌦏Uˮ��Ⱦ�ϵ��������Ԍ��191
5.15��øϵ�Ќ��194
5.15.1��ø�a�����ĺY�x195
5.15.2�߮a��ø����ø��Ĝy��197
5.15.3�߮a��ø�����ø�W����198
5.15.4��ø�Ĺ̶���199
5.16����΢���ʯ����Ⱦ�����������ޏ�200
5.17�ٽz��ĸ�ĔU�����B��������͵��Ƃ�203

���
���1���ע�����205
���2���׫�������206
���3���õĉA�����������̖�����_Һ207
���4���B���cԇ��������218
���5�|������ԇ���c���E222
���6DNA����ԭ��223
���7RNA����ԇ���c���E225

�����īI