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茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果)

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出版社:中國輕工業(yè)出版社出版時間:2025-01-01
開本: 其他 頁數(shù): 140
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茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果) 版權(quán)信息

茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果) 內(nèi)容簡介

本書系統(tǒng)闡述茶餅病的感病過程、生化變化、防治措施與生物信息學(xué)技術(shù)。以茶樹染病葉片為材料,通過測定內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)以明確真菌種群多樣性,開展微生物組、植物激素代謝組及其聯(lián)合分析,旨在探究茶樹與茶餅病之間相互作用機(jī)制,進(jìn)而明確防治策略。此外 ,該書從相關(guān)數(shù)據(jù)和圖表的含義、組成等方面,對微生物組、激素代謝組以及聯(lián)合分析的報(bào)告進(jìn)行解讀,以幫助研究人員深入理解生物信息技術(shù)研究結(jié)果、評估研究方法的可靠性以及挖掘在初步分析中被忽視的潛在信息。 本書可作為茶學(xué)專業(yè)研究生的參考書,也可作為茶樹病蟲害防治研究的支撐材料和多組學(xué)研究結(jié)果分析的輔助資料。

茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果)茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果) 前言

貴州省委、省政府加快發(fā)展特色優(yōu)勢產(chǎn)業(yè)戰(zhàn)略部署,著力推進(jìn)貴州省茶產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級。 然而,茶餅病是制約貴州地區(qū)茶葉產(chǎn)量和品質(zhì)的主要病害之一,包括作為中國歷史十大名茶的都勻毛尖,其茶葉原料也深受此病影響。 目前貴州茶葉產(chǎn)量居全國之首,還為其他品牌的茶葉供應(yīng)原料,這得益于貴州優(yōu)良的氣候條件和綠色無污染的生態(tài)環(huán)境。 為了保護(hù)環(huán)境和安全生產(chǎn),對茶樹病蟲害只能采用生態(tài)防治的措施。 因此,首先必須了解茶餅病的危害情況、形成原理及對茶葉產(chǎn)量和品質(zhì)的影響機(jī)制。
茶餅病又稱為皰狀葉枯病、葉腫病,主要為害茶樹嫩葉、新梢,常見于低溫、多霧、高濕、陰雨的茶區(qū)。 它由一種專性寄生真菌外擔(dān)子引起,通過氣載擔(dān)孢子傳播,即便處于病害閾值水平(≤35% )之下,也可嚴(yán)重影響茶葉產(chǎn)量和品質(zhì)。
本書主要內(nèi)容包括:茶樹茶餅病的感病過程、變化、茶餅病防治等研究進(jìn)展;與開展茶餅病研究相關(guān)的基因組學(xué)、真菌內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)測序、代謝組學(xué)、植物激素分析及相關(guān)組學(xué)的聯(lián)合分析等生物信息技術(shù)的介紹;茶樹感染茶餅病過程中的微生物組(通過 ITS 測定真菌多種多樣性)分析報(bào)告的解讀,包括真菌物種注釋、豐度展示、樣本比較和功能預(yù)測等;茶樹感染茶餅病過程中的植物激素代謝報(bào)告的解讀;茶樹感染茶餅病過程中的微生物組與植物激素代謝的聯(lián)合分析等報(bào)告的解讀。

茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果) 目錄

第1章 茶樹茶餅病概述
第1節(jié) 茶樹茶餅病的感病過程
第二節(jié) 茶樹感染茶餅病后的生物化學(xué)變化
第三節(jié) 茶樹茶餅病的防治

第二章 茶樹茶餅病生物信息學(xué)技術(shù)
第1節(jié) 基因組學(xué)技術(shù)
第二節(jié) 代謝組學(xué)技術(shù)
第三節(jié) 組學(xué)聯(lián)合分析

第三章 茶餅病內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)分析
第1節(jié) 物種注釋
第二節(jié) 樣本復(fù)雜度分析
第三節(jié) 多樣本比較分析
第四節(jié) 統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)
第五節(jié) 關(guān)聯(lián)分析與模型預(yù)測
第六節(jié) 功能預(yù)測

第四章 茶餅病植物激素代謝組分析
第1節(jié) 數(shù)據(jù)評估
第二節(jié) 差異代謝物篩選和統(tǒng)計(jì)
第三節(jié) 差異代謝物 KEGG 功能注釋及富集分析

第五章 茶餅病內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)與植物激素代謝組聯(lián)合分析
第1節(jié) 主成分分析
第二節(jié) Spearman 相關(guān)性分析
第三節(jié) Pearson 相關(guān)性分析
第四節(jié) 典型相關(guān)分析

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茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果) 相關(guān)資料

第一章茶樹茶餅病概述
茶餅病(Tea Blister Blight),又名葉腫病、皰狀葉枯病,常為害茶樹的嫩葉、新梢,在中國、印度、泰國、印度尼西亞、日本、斯里蘭卡、韓國等國家有廣泛的發(fā)生和 危害(Nagao,2012;Kwon et al. ,2003;Singh et al. ,2016;Singh et al. ,2019;Sinniah et al. ,2016);其由專性寄生真菌壞損外擔(dān)菌(Exobasidium vexans)引起,通過氣載 擔(dān)孢子傳播,即便處于病害閾值水平(≤35% )之下,也可嚴(yán)重影響茶葉產(chǎn)量和品 質(zhì)(Singh et al. ,2018;Premkumar et al. ,2008)。
E.vexans是茶樹中最具破壞性的葉面病原之一(Sharma et al. ,2007),是擔(dān)子菌門、外擔(dān)菌綱、外擔(dān)菌目、外擔(dān)菌科、外擔(dān)菌屬真菌;室內(nèi)培養(yǎng)20~30d 形成菌落 (Graafland,1952),感染初期菌絲為圓形,白色,天鵝絨狀,病害葉正面乳白色,背 面茶黃色(譚榮榮等,2015)。 擔(dān)孢子常見于病斑表面,貼附在小梗上,且易從小梗上剝離。擔(dān)孢子一般含1個分隔,萌發(fā)時期含3個分隔(Gadd,1948),且長出芽管,并膨大形成附著胞。
E.vexans主要感染茶樹嫩葉、嫩莖(Premkumar et al. ,2008),茶餅病常發(fā)生在低溫、高濕、陰雨、多霧的茶區(qū)(陳宗懋等,2013;Mabbett,2016);空氣溫度、濕度、降雨量以及光照等會影響病原侵染程度及孢子萌發(fā)過程(Mohktar et al. ,2019; Fauziyah et al. ,2018) ,其發(fā)病強(qiáng)度隨著降雨量和濕度的增加而增加,隨著環(huán)境 溫度的升高而降低(Rezamela et al. ,2016) ,在 20~25℃、相對濕度 80%或 90% 條件下的露水或雨水中有利于擔(dān)孢子的萌發(fā)。在適宜條件下,E.vexans病原可在茶樹上完成多個世代的繁殖( Premkumar et al. ,2008),一個世代需11~28d (Ram,1961)。

茶餅病微生物組與激素代謝組聯(lián)合分析(植物多組學(xué)解讀系列成果) 作者簡介

梅鑫,美國南伊利諾伊州大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后,現(xiàn)為黔南民族師范學(xué)院副教授。
周小露,泰國蘇蘭拉里理工大學(xué)博士研究生。
崔寶祿,教授,博士,雙師型教師,現(xiàn)任黔南師院生物科學(xué)與農(nóng)學(xué)院黨委副書記、院長。畢業(yè)于重慶大學(xué)生物學(xué)專業(yè),研究方向?yàn)橹参锓肿由飳W(xué),主持國家自然基金地區(qū)項(xiàng)目1項(xiàng)、地廳級項(xiàng)目5項(xiàng),主持完成省教育廳農(nóng)業(yè)重大科研攻關(guān)項(xiàng)目1項(xiàng)、教育廳拔尖人才項(xiàng)目1項(xiàng)、省科技廳基礎(chǔ)研究計(jì)劃項(xiàng)目1項(xiàng)。授權(quán)發(fā)明專利1項(xiàng),實(shí)用新型專利6項(xiàng)。承擔(dān)《分子生物學(xué)》《基因工程》《生物化學(xué)》等教學(xué)任務(wù)。

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