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包郵 計算生物學

作者:張巖主編
出版社:科學出版社出版時間:2023-09-01
開本: 26cm 頁數: 266頁
本類榜單:教材銷量榜
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計算生物學 版權信息

計算生物學 內容簡介

本書是一本專門針對計算生物學領域的系統性教材,通過本教材的學習,可以掌握多種組學數據分析的原理和方法,包括高通量數據分析和單細胞測序數據的分析(**章、第二章)、蛋白質組學及其功能預測(第三章)、計算表觀遺傳學(第五章)。在計算生物學的多學科應用上,本教材涵蓋了分子進化的計算生物學分析(第四章)、計算癌癥生物學(第六章)、計算免疫學(第七章)、藥物設計的計算方法和應用(第八章)、影像組學與人工智能(第九章)、基因編輯系統的識別與功能分析(第十章)等應用內容,使讀者能夠掌握常用的基本算法、模型,從廣度和深度突出解決生物學領域的計算需求。同時,在第十一章介紹了計算生物學領域的大數據資源及工具。

計算生物學 目錄

目錄 前言 緒論 1 **節 計算生物學的起源和研究內容 1 第二節 計算生物學的數學、統計學基礎2 第三節 計算機科學基礎 7 本章小結 15 **章 高通量數據分析 16 **節 基因組組裝 16 第二節 基因變異檢測 19 第三節 RNA測序分析的基本方法 25 第四節 基因的注釋 34 第五節 差異表達基因的篩選 36 第六節 基因功能的富集分析 39 本章小結 44 第二章 單細胞測序數據的分析 46 **節 單細胞測序技術 46 第二節 單細胞轉錄組數據預處理 52 第三節 單細胞轉錄組數據分析方法 56 案例分析:單細胞轉錄組數據聚類分析61 本章小結 62 第三章 蛋白質組學及其功能預測 64 **節 蛋白質組學概述 64 第二節 蛋白質結構預測 70 第三節 蛋白質功能預測 74 案例分析:蛋白質二級結構預測 80 本章小結 83 第四章 分子進化的計算生物學分析 85 **節 分子進化的基本概念 85 第二節 系統發育樹的構建 91 第三節 系統發育樹的應用 102 案例分析:基于全基因組序列的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)多算法系統發育樹分析 104 本章小結 106 第五章 計算表觀遺傳學 108 **節 基因組的DNA甲基化及數據分析 108 第二節 組蛋白修飾及數據分析 120 本章小結 127 第六章 計算癌癥生物學 128 **節 癌癥生物標記亞型鑒定方法 128 第二節 癌癥預警和風險評估模型 136 第三節 癌癥個性化治療 142 本章小結 145 第七章 計算免疫學 146 **節 計算免疫學概述 146 第二節 腫瘤免疫浸潤分析方法 148 第三節 腫瘤抗原鑒定的計算 156 第四節 T細胞受體的分析 164 案例分析:免疫細胞浸潤算法工具的實踐 167 本章小結 182 第八章 藥物設計的計算方法和應用 184 **節 藥物性質計算 184 第二節 藥物設計方法 191 第三節 精準用藥 204 本章小結 206 第九章 影像組學與人工智能 208 **節 影像組學 208 第二節 影像組學的分析方法 213 案例分析:構建卷積神經網絡進行圖片分類預測 223 本章小結 224 第十章 基因編輯系統的識別與功能分析 226 **節 基因編輯系統概述 226 第二節 基因編輯技術的發展歷程 226 第三節 基因編輯工具 229 本章小結 233 第十一章 大數據資源及工具 234 **節 大型測序數據庫 234 第二節 數據分析在線資源 250 本章小結 261 主要參考文獻 262
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