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晶體結構精修——晶體學者的SHELXL軟件指南 版權信息
- ISBN：9787040288803
- 條形碼：9787040288803 ; 978-7-04-028880-3
- 裝幀：一般膠版紙
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>
晶體結構精修——晶體學者的SHELXL軟件指南 內容簡介
SHELXL是目前靠前上使用很廣泛的結構精修程序，不僅功能比較強大，而且使用比較方便。本書既是一本面向晶體學者的SHELXL軟件指南，也是一本教科書，它涵蓋了大量晶體結構精修中可能遇到的難題，一步一步展示晶體結構精修的方方面面，并通過示例文件和詳細講解說明問題、闡述機理。隨書光盤提供了重現這些精修過程需要的所有文件，方便讀者自行練習和對照。 對于具有初步X射線晶體結構測定的基礎、能運行相關軟件的入門者，本書是一本很好很好的教材；即使對于多年從事晶體結構解析的專家，本書也有很好的參考價值。
晶體結構精修——晶體學者的SHELXL軟件指南 目錄
1 SHELXL
1.1 SHELX程序包
1.1.1 SHELXTL和其他程序
1.2 SHELXL
1.2.1 程序組成
1.2.2 指令文件name.ins
1.2.3 衍射數據文件name.hkl
1.2.4 SHELXL中的數據合并
1.2.5 連通性表
2 晶體結構精修
2.1 *小二乘精修
2.1.1 精修應基于F還是F2——這會成為問題嗎？
2.2 弱數據點和高分辨率截斷
2.3 殘差因子
2.4 參數
2.5 約束
2.5.1 位置占有率因子
2.5.2 特殊位置約束
2.5.3 剛性基團約束
2.5.4 浮動原點約束
2.5.5 氫原子
2.5.6 SHELXL中的約束用法
2.6 限制
2.6.1 幾何限制
2.6.2 位移參數的限制
2.6.3 其他限制
2.7 SHELXL中的自由變量
2.8 結果
2.8.1 鍵長和鍵角
2.8.2 扭轉角
2.8.3 共面原子
2.8.4 氫鍵
2.8.5 RTAB指令
2.8.6 MORE指令
2.8.7 cif文件
2.9 精修問題
3 氫原子
3.1 氫原子的X-H鍵長和Ueq數值
3.2 與不同類型原子成鍵的氫
3.2.1 與碳原子成鍵的氫
3.2.2 與氮或氧成鍵的氫
3.2.3 與金屬成鍵的氫
3.3 在SHELXL中定位氫原子
3.3.1 HFIX指令中*常用的m和n取值列表
3.3.2 酸性氫原子的準自由精修
3.4 XHELXL中的氫鍵信息
3.5 示例
3.5.1 常規氫原子定位操作：C31H54MoN2O2
3.5.2 Zr基氫化物中的氫原子
3.5.3 酸性氫原子和氫鍵
4 原子類型的指定
4.1 電子皆“藍色
4.2 化學知識
4.3 晶體學知識
4.4 示例
4.4.1 四聯InCl3——N還是O？
4.4.2 鈷基化合物
4.4.3 搞混的中心金屬原子
5 無序
5.1 無序類型
5.1.1 置換無序
5.1.2 位置無序
5.1.3 混亂——一種特殊的無序
5.2 無序的精修
5.2.1 用SHELXL精修無序
5.3 示例
5.3.1 鎵亞胺基硅酸鹽——兩乙基無序
5.3.2 Ti（Ⅲ）基化合物的無序
5.3.3 按占據無序處理的共晶
5.3.4 溶劑分子無序
5.3.5 結構中三種無序共存——環正聚四苯撐
6 贗對稱
6.1 全局贗對稱性
6.2 真正NCS
6.3 示例
6.3.1 Pn還是P21/n
6.3.2 [Si（NH2）2CH（SiMe3）2]2：P1，Z=12
7 孿晶
7.1 孿晶的定義
7.2 孿晶的分類
7.2.1 缺面孿晶
7.2.2 贗缺面孿晶
7.2.3 交錯缺面孿晶
7.2.4 非缺面孿晶
7.3 孿晶檢驗
7.4 結構解析
7.5 孿晶精修
7.6 絕對結構確定
7.7 孿晶的警示
7.8 示例
7.8.1 缺面孿晶
7.8.2 贗缺面孿晶的一個示例
7.8.3 交錯缺面孿晶的個示例
7.8.4 交錯缺面孿晶的第二個示例
7.8.5 非缺面孿晶的個示例
7.8.6 非缺面孿晶的第二個示例
7.9 結論
8 贗像
8.1 什么是贗像？
8.1.1 振動
8.1.2 縮短的三重鍵
8.1.3 氫原子位置
8.1.4 傅里葉截斷誤差
8.2 什么是非贗像？
8.3 示例
8.3.1 C30H47N9Zr5中的傅里葉截斷誤差
9 結構驗證
9.1 驗證
9.2 PLATON有效性測試
9.2.1 對稱缺失
9.2.2 孔隙
9.2.3 位移橢球
9.2.4 鍵長和鍵角
9.2.5 原子類型指定
9.2.6 分子間接觸
9.2.7 氫鍵
9.2.8 連通性
9.2.9 無序
9.2.10衍射數據
9.2.11精修參數結果
9.3 何時開始驗證？
9.4 結束語
10 蛋白質精修
10.1 原子分辨率精修與標準精修的對比
10.11 各向異性位移參數
……
11 蛋白質結構的（交叉）驗證
12 總論
參考文獻
進階讀物
索引
光盤文件勘誤說明
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