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進化基因組學(xué)的統(tǒng)計理論與方法 版權(quán)信息
- ISBN：9787309139204
- 條形碼：9787309139204 ; 978-7-309-13920-4
- 裝幀：平裝-膠訂
- 冊數(shù)：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>>
進化基因組學(xué)的統(tǒng)計理論與方法 內(nèi)容簡介
進化基因組學(xué)是當(dāng)今生命科學(xué)發(fā)展前沿，該書系統(tǒng)闡述了運用數(shù)理統(tǒng)計學(xué)方法研究分子進化和比較基因組的思路和方法，側(cè)重于對重要基本概念、計算模型和不同計算方法適用性的介紹，避免了繁雜的數(shù)學(xué)推導(dǎo)和論證過程，并通過一些具體實例介紹了如何從基因組層面運用統(tǒng)計理論和方法研究基因重復(fù)和功能分化、研究基因多效性與蛋白序列的關(guān)系、研究基因重復(fù)與基因組進化的關(guān)系，具很強的實用性，是進化生物學(xué)、計算生物學(xué)和生物信息學(xué)領(lǐng)域一本重要的參考書。
進化基因組學(xué)的統(tǒng)計理論與方法 目錄
**章 分子進化基礎(chǔ)
1.1 DNA序列的進化距離
1.2 蛋白質(zhì)編碼序列的進化距離
1.3 系統(tǒng)發(fā)育樹：概述
1.4 系統(tǒng)發(fā)育推斷的距離法
1.5 系統(tǒng)發(fā)育推斷的簡約法
1.6 系統(tǒng)發(fā)育推斷的*大似然（ML）法
1.7 系統(tǒng)發(fā)育推斷的貝葉斯法
1.8 祖先序列推斷
1.9 位點間的速率變化
第二章 生物信息學(xué)和統(tǒng)計學(xué)基礎(chǔ)
2.1 進化基因組學(xué)的生物信息資源
2.2 同源搜索的基本統(tǒng)計學(xué)
2.3 序列比對
2.4 微陣列和統(tǒng)計學(xué)
2.5 馬爾可夫鏈蒙特卡羅(MCMC)
第三章 基因重復(fù)后的功能分化：統(tǒng)計學(xué)模型
3.1 功能分化建模
3.2 I-型功能分化的泊松模型
3.3 I-型功能分化的馬爾可夫鏈模型
3.4 Ⅱ一型功能分化的統(tǒng)計學(xué)模型
3.5 I-型和Ⅱ-型功能分化的統(tǒng)一模型
第四章 基因重復(fù)后的功能分化：應(yīng)用和其他
4.1 基于DIVERGE的分析
4.2 功能距離分析
4.3 I-型功能分化的其他方法
第五章 重復(fù)基因的系統(tǒng)發(fā)育轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
5.1 與布朗運動相關(guān)的隨機模型
5.2 祖先基因表達推斷
5.3 Oakley等的模型
5.4 穩(wěn)定選擇下的表達趨異：Ornstein-Uhlenback(OU）
模型
5.5 實驗相關(guān)性下的似然性與距離方法
5.6 一個例子：酵母GlnS基因家族
5.7 基于大規(guī)模并行測序技術(shù)的表達趨異估計
第六章 重復(fù)基因間的表達：全基因組分析
6.1 編碼序列分化與表達趨異
6.2 重復(fù)基因間調(diào)控基序分化與表達趨異
6.3 基因重復(fù)與表達多樣化
6.4 表達趨異與重復(fù)基因的保留
6.5 表達趨異的進化距離
6.6 酵母重復(fù)基因的表達分化速率
6.7 基因重復(fù)后的不對稱表達進化
6.8 結(jié)論
第七章 基因組進化的組織驅(qū)使假說
7.1 基因組進化的組織驅(qū)使假說
7.2 檢驗組織驅(qū)使假說
7.3 表達進化的復(fù)合泊松模型
7.4 人腦中的表達改變
第八章 基因多效性與蛋白質(zhì)序列進化
8.1 蛋白質(zhì)序列進化模型
8.2 選擇強度與模型分類
8.3 蛋白質(zhì)序列的進化速率
8.4 基因多效性和選擇強度的估計
8.5 基因多效性的初步分析
8.6 基因多效性評述
第九章 基于基因含量的基因組進化模型
9.1 基因含量進化的生滅模型
9.2 簡單基因含量下的四基因組似然性
9.3 水平基因轉(zhuǎn)移中的生滅模型
9.4 其他模型
第十章 系統(tǒng)生物學(xué)和網(wǎng)絡(luò)進化中的重要話題
10.1 GC突變偏差而不是適應(yīng)驅(qū)動了多細(xì)胞動物基因組
進化中的酪氨酸丟失
10.2 重復(fù)基因?qū)z傳穩(wěn)健性的貢獻
10.3 基因與基因相互作用的進化
10.4 模塊性和復(fù)雜性的起源
10.5 網(wǎng)絡(luò)基序分析與酵母基因組重復(fù)
10.6 重復(fù)基因的進化動力學(xué)（EK）分析
參考文獻
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