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系統生物學與發酵工程 版權信息
- ISBN：9787518423187
- 條形碼：9787518423187 ; 978-7-5184-2318-7
- 裝幀：平裝-膠訂
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>>
系統生物學與發酵工程 本書特色
在生物技術迅猛發展的今天，系統生物學與發酵工程的結合已成為推動行業進步的關鍵力量。本書以其系統性、專業性、前沿性三大亮點，為讀者揭開了生物工程的神秘面紗。從基因到產品，本書不僅深入探討了發酵工程的科學原理，更強調了工程實踐與應用，不僅適合作為高等院校生物科學、生物技術、生物工程、生物制藥和食品工程等專業的教學用書，也可作為相關專業的研究生、教師、研究人員及從事生物技術產業的工程人員的參考用書。
系統生物學與發酵工程 內容簡介
本書主要內容包括系統生物學資源庫和研究工具；重要發酵工業微生物的全基因組規模網絡模型的構建與應用；系統生物學在維生素C、燃料乙醇、丙酮酸發酵、益生菌生產、白酒釀造中的應用以及系統生物學在畢赤酵母生產外源蛋白中的應用。
系統生物學與發酵工程 目錄
第1章 緒 論 第1節 系統生物學的發展概況一、 系統生物學的產生和發展二、 系統生物學的研究內容和方法三、 系統生物學的實踐第二節 系統生物學在發酵工程中的應用與發展趨勢一、 工業系統生物學與系統代謝工程二、 工業系統生物學的應用三、 工業系統生物學的發展趨勢參考文獻第二章 系統生物學資源庫和研究工具 第1節 綜合性組學數據庫一、 美國國家生物技術信息中心二、 歐洲生物信息研究所數據庫 第1章 緒 論 第1節 系統生物學的發展概況一、 系統生物學的產生和發展二、 系統生物學的研究內容和方法三、 系統生物學的實踐第二節 系統生物學在發酵工程中的應用與發展趨勢一、 工業系統生物學與系統代謝工程二、 工業系統生物學的應用三、 工業系統生物學的發展趨勢參考文獻第二章 系統生物學資源庫和研究工具 第1節 綜合性組學數據庫一、 美國國家生物技術信息中心二、 歐洲生物信息研究所數據庫三、 日本 DNA 數據庫四、 中國國家基因庫第二節 生物途徑網絡數據庫一、 綜合性代謝途徑數據庫二、 轉錄調控途徑數據庫三、 細胞信號通路數據庫第三節 蛋白質結構與相互作用數據庫一、 蛋白質結構數據庫二、 蛋白與蛋白相互作用數據庫第四節 生物系統建模和模擬工具一、 系統生物模型標記語言和圖注二、 系統生物網絡模型類型三、 生物網絡模擬編輯工具四、 Cytoscape 數據整合及網絡顯示平臺軟件參考文獻第三章 重要發酵工業微生物的全基因組規模網絡模型的構建與應用 第1節 基因組規模生物網絡概述一、 基于組學大數據構建基因組規模生化模型二、 基因組規模生物網絡模型解析微生物生理特性三、 基于基因組規模生物網絡發展菌種生產性能優化策略第二節 基因組規模代謝網絡模型一、 基因組規模代謝網絡模型的進展二、 基因組規模代謝網絡模型的構建三、 基因組規模代謝網絡數據庫平臺第三節 基因組規模輔因子網絡模型的構建一、 基因組規模輔因子網絡模型 icmNX6434 的構建二、 基于模型 icmNX6434 解析輔因子代謝途徑三、 基于模型 icmNX6434 解析工業微生物生產發酵特性第四節 基因組規模轉錄調控網絡模型的構建一、 轉錄調控網絡的數學表述二、 轉錄調控網絡的構建方法第五節 蛋白質互作網絡模型的構建一、 蛋白質和蛋白質相互作用二、 蛋白質和小分子相互作用第六節 基因組酶約束互作網絡模型的構建一、 基因組規模酶約束模型研究進展二、 大腸桿菌酶約束模型 ec_ iML1515 的構建第七節 微生物全細胞模型一、 微生物全細胞模型研究進展二、 釀酒酵母全細胞模型參考文獻第四章 系統生物學在維生素 C 發酵中的應用 第1節 維生素 C 生產菌株基因組學研究一、 普通生酮基古龍酸菌的全基因組測序和功能基因分析二、 巨大芽孢桿菌的全基因組測序和分析第二節 K. vulgare 基因組規模代謝網絡模型的構建與應用 一、 K. vulgare 基因組規模代謝網絡模型的構建和基本特征二、 基于模型 iWZ663 對 K. vulgare 的生理性能分析三、 基于模型 iWZ663 解析 K. vulgare 合成 2-酮基-L-古龍酸第三節 巨大芽孢桿菌基因組規模代謝網絡模型的構建與應用一、 巨大芽孢桿菌基因組規模代謝網絡模型的構建和基本特征二、 基于模型 iMZ1055 對巨大芽孢桿菌生理特性的解析第四節 兩菌代謝互作網絡模型的構建與應用一、 基于已有組學數據對兩菌關系的解析二、 兩菌代謝互作網絡模型 iWZ-KV-663-BM-1055 的構建三、 基于 iWZ-KV-663-BM-1055 解析兩菌相互作用第五節 基于 GSMMs 優化營養供給提高維生素 C 生產效率一、 基于 GSMMs 確定 K. vulgare 的*小合成培養基二、 基于 K. vulgare 生長營養譜優化維生素 C 生產三、 基于 GSMMs 評價山梨糖對 B. megaterium 裂解形成芽孢的影響參考文獻第五章 系統生物學在燃料乙醇發酵中的應用 第1節 單雙倍體酵母對乙醇耐受性的組學研究一、 單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的轉錄組學分析二、 單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的代謝物組學分析三、 單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的蛋白組學分析四、 單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的比較脂組學研究第二節 釀酒酵母對糠醛和乙酸?響應轉錄組學研究一、 釀酒酵母對糠醛的轉錄組水平響應二、 釀酒酵母耐受菌對糠醛的轉錄組水平響應三、 釀酒酵母對乙酸的轉錄組水平響應四、 釀酒酵母耐受菌對乙酸的轉錄組水平響應第三節 糠醛和苯酚對釀酒酵母的作用定量蛋白質組學一、 釀酒酵母及糠醛耐受菌株的比較蛋白質組學研究二、 釀酒酵母及苯酚耐受菌株的比較蛋白質組學研究第四節 乙醇發酵過程中的比較脂組學研究一、 釀酒酵母普通菌株和木糖利用菌在不同培養基中的發酵情況二、 膜上磷脂的變化與酵母菌株乙醇發酵的關系參考文獻第六章 系統代謝工程在丙酮酸發酵生產中的應用 第1節 光滑球擬酵母全基因組解析一、 丙酮酸工業菌株光滑球擬酵母全基因組測序二、 光滑球擬酵母基因組規模代謝模型的構建和基本特征三、 基于全基因組代謝模型解析光滑球擬酵母高產丙酮酸的生產性能第二節 光滑球擬酵母生產丙酮酸中 NADH 的生理功能解析一、 基于組學技術解析光滑球擬酵母異源 NAD / H 再生系統二、 異源 NAD / H 再生系統對丙酮酸合成途徑的影響三、 異源 NAD / H 再生系統對丙酮酸分解途徑的影響第三節 光滑球擬酵母耐受高滲透壓脅迫的生理機制研究一、 高滲脅迫對光滑球擬酵母生長和發酵性能的影響二、 高滲脅迫對光滑球擬酵母基因表達的影響三、 高滲脅迫對光滑球擬酵母蛋白質表達的影響四、 基于組學技術提高 C. glabrata 抵御高鹽脅迫能力的策略第四節 光滑球擬酵母應答酸脅迫的生理機制一、 轉錄因子 Asg1p 和 Ha19p 應答酸脅迫的生理機制二、 轉錄因子 Crz1p 調控光滑球擬酵母應答酸脅迫的生理機制三、 中介體亞基 CgMED3 調控光滑球擬酵母適應酸環境的生理機制四、 中介體亞基 CgMED15B 調控光滑球擬酵母適應酸環境的生理機制參考文獻第七章 系統生物學在益生菌 Lactobacillus casei Zhang發酵中的應用 第1節 益生菌 L. casei Zhang 的基因組學研究 一、 L. casei Zhang 基因組的基本特征二、 L. casei Zhang 代謝功能基因分析三、 L. casei Zhang 與環境的相互作用 第二節 L. casei Zhang 比較轉錄組學研究 一、 L. casei Zhang 在牛乳發酵過程中的不同基因表達譜二、 L. casei Zhang 在豆乳發酵過程中的不同基因表達譜第三節 益生菌 L. casei Zhang 比較蛋白質組學研究益生菌 一、 蛋白質組學分析 L. casei Zhang 在牛乳和豆乳中的生長差異二、 不同酸性環境對 L. casei Zhang 蛋白質組表達譜的影響三、 膽鹽脅迫蛋白質組研究第四節 益生菌 L. casei Zhang 連續傳代中的基因組穩定性研究一、 微生物遺傳穩定性研究二、 L. casei Zhang 傳代期間的基因組穩定性 參考文獻第八章 系統生物學在白酒釀造中的應用 第1節 白酒釀造中的微生物群落及其結構演變規律一、 中國白酒微生物菌群結構的分子生態學分析方法的建立二、 濃香型白酒微酒醅中微生物群落的研究三、 清香型白酒微生物群落結構演變規律的研究四、 醬香型白酒發酵中微生物群落結構的研究第二節 基于代謝組學的白酒風味物質研究一、 風味物質研究的技術方法體系二、 不同香型白酒風味活性物質三、 生物活性新物質的發現第三節 基于基因組學的特征風味強化及不良風味消除技術一、 不同香型白酒特征風味活性物質的產生二、 基于基因組學的白酒微生物發酵風味調控三、 基于分子生物學的不良風味消除技術參考文獻第九章 系統生物學在畢赤酵母生產外源蛋白中的應用 第1節 巴斯德畢赤酵母基因組學研究一、 巴斯德畢赤酵母的全基因組測序二、 巴斯德畢赤酵母的基因組注釋第二節 巴斯德畢赤酵母的全基因組規模代謝模型一、 畢赤酵母模型 iRY1243 的構建和基本特征 二、 畢赤酵母代謝網絡模型的驗證和應用第三節 畢赤酵母轉錄組學優化一、 基于 RNA-Seq 對畢赤酵母轉錄結構的分析二、 畢赤酵母不同碳源誘導下基因差異表達分析三、 提高目的基因轉錄水平增加人胰島素前體產量第四節 高表達外源蛋白的畢赤酵母細胞的蛋白表達分析一、 基于 iTRAQ 技術的畢赤酵母蛋白質組學二、 不同碳源下畢赤酵母蛋白表達分析三、 降低目的蛋白降解參考文獻
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系統生物學與發酵工程 作者簡介
劉立明，男，1976年3月出生，長江學者，江南大學生物工程學院畢業，博士學位，江南大學食品科學與技術國家重點實驗室教授，博士生導師，中國微生物學會會員，中國生物工程學會會員。
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