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差異表達基因檢測數據分析研究 版權信息
- ISBN:9787568298469
- 條形碼:9787568298469 ; 978-7-5682-9846-9
- 裝幀:一般膠版紙
- 冊數:暫無
- 重量:暫無
- 所屬分類:>
差異表達基因檢測數據分析研究 內容簡介
本文研究單基因水平基因表達譜數據的差異表達基因檢測方法, 提出了采用三均值和三均值絕對離差為統計量, 利用樣本信息和穩健性特征, 用于差異表達基因檢測, 以較全面、穩定的表示樣本信息 ; 在ORT方法基礎上提出了TriORT差異表達基因檢測方法, 利用四分位差判斷基因芯片數據的異常差異值 ; 提出了基于三均值的TriMOST差異表達基因檢測方法, 通過用三均值和三均值絕對差對樣本表達值進行轉換 ; 對比分析了改進方法和已有差異表達基因檢測方法在乳腺癌真實數據上的應用, 為揭示疾病發病機制等提供算法幫助。
差異表達基因檢測數據分析研究 目錄
第1章 緒論
1.1 生物芯片概述
1.2 基因芯片簡介
1.2.1 基因芯片的原理
1.2.2 基因芯片的分類
1.2.3 基因芯片的應用
1.3 差異表達基因檢測統計方法
1.3.1 差異表達基因檢測概述
1.3.2 傳統的差異表達基因檢測方法
1.3.3 其他相關的差異表達基因檢測方法
1.4 變點問題的研究
1.5 變點理論應用于差異表達基因檢測
1.6 微陣列基因芯片數據的網絡資源介紹
1.7 基于云計算的差異表達基因檢測
1.8 小結
第2章 差異表達基因檢測樣本子集過表達的統計方法
2.1 生物學背景
2.2 差異表達基因檢測統計方法介紹
2.2.1 基于均值的差異表達基因檢測方法
2.2.2 基于中值的差異表達基因檢測方法
2.2.3 基于樣本表達值特定百分比的差異表達基因檢測方法
2.3 實驗與分析
2.3.1 ROC曲線比較
2.3.2 FDR曲線比較
2.3.3 算法分析
2.4 小結
第3章 TriORT差異表達基因檢測統計方法
3.1 引言
3.2 TriORT方法
3.3 實驗與分析
3.3.1 仿真研究
3.3.2 真實數據研究
3.4 小結
第4章 TriMOST差異表達基因檢測統計方法
4.1 引言
4.2 TriMOST方法
4.3 實驗與分析
4.3.1 仿真研究
4.3.2 真實數據研究
4.4 小結
第5章 差異表達基因檢測統計方法在乳腺癌數據上的應用
5.1 引言
5.2 差異表達基因檢測方法
5.2.1 已有方法介紹
5.2.2 TriORT方法和TriMOST方法
5.3 實驗與分析
5.3.1 ROC曲線仿真實驗
5.3.2 FDR曲線仿真實驗
5.3.3 真實數據集實驗
5.3.4 各方法找到的與乳腺癌相關的基因分析
展開全部
差異表達基因檢測數據分析研究 作者簡介
紀兆華,北京信息職業技術學院教授,吉林大學計算機科學與技術學科(生物信息學方向)博士、吉林大學信息與通信工程學科博士后、北京工業大學環境科學與工程學科博士后、中國科學院北京基因組研究所訪問學者。
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