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計算機輔助藥物設計理論及應用 版權信息
- ISBN：9787030585301
- 條形碼：9787030585301 ; 978-7-03-058530-1
- 裝幀：暫無
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>>
計算機輔助藥物設計理論及應用 本書特色
計算機輔助藥物設計以化學和生物理論為基礎，通過分子模擬、預測藥物與靶點之間的分子識別，設計和優化先導化合物，在新藥研發中發揮著不可或缺的作用。《計算機輔助藥物設計理論及應用》針對學生在計算機輔助藥物設計學習過程中可能遇到的各種問題，介紹了數據庫、定量構效關系、藥效團、分子對接、虛擬篩選、同源模建、分子動力學模擬、自由能計算理論以及藥物設計過程中常用軟件和數值計算方法。《計算機輔助藥物設計理論及應用》覆蓋全面，簡單實用，加入了大量應用實例，穿插操作方法和技巧；每個章節自成體系，從易到難，層次分明。
計算機輔助藥物設計理論及應用 內容簡介
《計算機輔助藥物設計理論及應用》主要介紹了與計算機輔助藥物設計相關的基礎理論和實例操作，內容涉生物化學，常用的數據庫和基礎軟件，QSAR，藥效團，分子對接，虛擬篩選，同源模建，結合自由能和能量分解，粗粒化，自由能曲面等。重在幫助學生簡單理解本學科的基本原理，然后從實驗操作入手，快速的掌握相關軟件的使用方法。從分子層次上理解蛋白質的結構-功能關系和運動性質，培養學生利用計算機技術解決和藥物有關問題的能力，并激發學生的科研興趣。《計算機輔助藥物設計入門教程》可供從事計算化學，藥物研發的科研工作者使用，也可作為藥物和計算機專業本科生、研究生的教材。
計算機輔助藥物設計理論及應用 目錄
目錄
**章 緒論（1）
**節 新藥開發的基本途徑和方法（1）
第二節 計算機輔助藥物設計的常用研究方法（10）
第三節 計算機輔助藥物設計的常用軟件（14）
第四節 近年來CADD在藥物設計中的應用實例（19）
參考文獻（21）
第二章 計算機輔助藥物設計的相關基礎（23）
**節 計算機輔助藥物設計的生命科學基礎（23）
第二節 計算機輔助藥物設計的藥學基礎（40）
第三節 計算機輔助藥物設計的Linux基礎（48）
參考文獻（62）
第三章 常用數據庫和基礎軟件的使用（64）
**節 藥物設計常用數據庫（64）
第二節 藥物和靶點的三維結構顯示及繪制軟件（79）
第三節 EndNote文獻管理（85）
參考文獻（91）
第四章 基于配體的藥物分子設計（92）
**節 定量構效關系（QSAR）（92）
第二節 藥效團模型（119）
參考文獻（125）
第五章 基于受體的藥物分子設計（129）
**節 分子對接的原理和分類（129）
第二節 分子對接的搜索算法（130）
第三節 分子對接的打分函數（134）
第四節 分子對接的操作流程（138）
第五節 分子對接實例（144）
第六節 虛擬篩選實例（147）
參考文獻（153）
第六章 蛋白質結構預測及全新藥物設計（158）
**節 同源建模（158）
第二節 同源模建實例（171）
第三節 蛋白質結合位點預測（178）
第四節 全新藥物設計方法（182）
參考文獻（186）
第七章 分子動力學模擬（190）
**節 分子動力學模擬的原理（190）
第二節 恒溫恒壓分子動力學模擬與溶劑模型（196）
第三節 分子動力學模擬的主要步驟（201）
第四節 分子動力學模擬應用實例（210）
參考文獻（231）
第八章 結合自由能的計算（234）
**節 生物大分子體系結合自由能研究的背景及意義（234）
第二節 結合自由能計算方法（238）
第三節 基于MM/PBSA自由能算法的操作實例（241）
第四節 自由能計算實例（247）
參考文獻（258）
第九章 藥物靶點的構象分析（260）
**節 藥物靶點基礎（260）
第二節 粗粒化模型（262）
第三節 自由能曲面（275）
第四節 聚類分析（279）
第五節 自由能曲面和聚類分析實例（282）
第六節 ProDy使用（286）
參考文獻（291）
第十章 藥物設計常用的數值分析（295）
**節 相關和回歸分析（295）
第二節 ROC曲線（305）
第三節 基于貝葉斯分類的類藥性預測（313）
第四節 Matlab在藥物設計中的應用（322）
參考文獻（337）
附錄 常用Linux計算軟件的安裝（339）
中英文對照索引（347）
附圖（363）
**章 緒論（1）
**節 新藥開發的基本途徑和方法（1）
第二節 計算機輔助藥物設計的常用研究方法（10）
第三節 計算機輔助藥物設計的常用軟件（14）
第四節 近年來CADD在藥物設計中的應用實例（19）
參考文獻（21）
第二章 計算機輔助藥物設計的相關基礎（23）
**節 計算機輔助藥物設計的生命科學基礎（23）
第二節 計算機輔助藥物設計的藥學基礎（40）
第三節 計算機輔助藥物設計的Linux基礎（48）
參考文獻（62）
第三章 常用數據庫和基礎軟件的使用（64）
**節 藥物設計常用數據庫（64）
第二節 藥物和靶點的三維結構顯示及繪制軟件（79）
第三節 EndNote文獻管理（85）
參考文獻（91）
第四章 基于配體的藥物分子設計（92）
**節 定量構效關系（QSAR）（92）
第二節 藥效團模型（119）
參考文獻（125）
第五章 基于受體的藥物分子設計（129）
**節 分子對接的原理和分類（129）
第二節 分子對接的搜索算法（130）
第三節 分子對接的打分函數（134）
第四節 分子對接的操作流程（138）
第五節 分子對接實例（144）
第六節 虛擬篩選實例（147）
參考文獻（153）
第六章 蛋白質結構預測及全新藥物設計（158）
**節 同源建模（158）
第二節 同源模建實例（171）
第三節 蛋白質結合位點預測（178）
第四節 全新藥物設計方法（182）
參考文獻（186）
第七章 分子動力學模擬（190）
**節 分子動力學模擬的原理（190）
第二節 恒溫恒壓分子動力學模擬與溶劑模型（196）
第三節 分子動力學模擬的主要步驟（201）
第四節 分子動力學模擬應用實例（210）
參考文獻（231）
第八章 結合自由能的計算（234）
**節 生物大分子體系結合自由能研究的背景及意義（234）
第二節 結合自由能計算方法（238）
第三節 基于MM/PBSA自由能算法的操作實例（241）
第四節 自由能計算實例（247）
參考文獻（258）
第九章 藥物靶點的構象分析（260）
**節 藥物靶點基礎（260）
第二節 粗粒化模型（262）
第三節 自由能曲面（275）
第四節 聚類分析（279）
第五節 自由能曲面和聚類分析實例（282）
第六節 ProDy使用（286）
參考文獻（291）
第十章 藥物設計常用的數值分析（295）
**節 相關和回歸分析（295）
第二節 ROC曲線（305）
第三節 基于貝葉斯分類的類藥性預測（313）
第四節 Matlab在藥物設計中的應用（322）
參考文獻（337）
附錄 常用Linux計算軟件的安裝（339）
中英文對照索引（347）
附圖（363）
展開全部
計算機輔助藥物設計理論及應用 作者簡介
胡建平，1978年生，湖南永州人，博士，教授，藥物化學碩士生導師，四川省學術和技術帶頭人后備人選，成都大學學術帶頭人。1999年畢業于吉林大學生命科學學院生物制藥專業；2008年畢業于北京工業大學生命科學與生物工程學院生物醫學工程專業，獲得北京工業大學優秀博士學位論文獎（排名第3，獲獎率＜8%），指導老師是王存新教授。2013年6月作為學術帶頭人調入成都大學藥學與生物工程學院工作。2015年3月～2016年3月在美國匹茲堡大學藥學院做訪問學者。從2000年至今，一直從事基于化學和生物信息學的分子模擬研究。目前的研究方向為藥物靶點一配體的相互作用以及計算機輔助藥物設計，篩選和生物活性評價等。主講課程有藥物合成反應、藥物設計學、制藥工藝學、計算機輔助藥物分子設計、生物信息學和計算機在化學中應用等。截至2019年3月，在國內外期刊及會議上發表學術論文105篇，SCI檢索論文60篇，其中第一作者及通訊作者SCI檢索論文42篇，引用500余次；主編教材2部，參編2部；主持完成2項國家級、2項省部級和10余項市廳級課題。目前是“藥食同源植物資源開發四川省高校重點實驗室”的主要成員。
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