序
前言
**章 總論
**節(jié) 種質資源研究現(xiàn)狀
一、形態(tài)學
二、細胞遺傳學
三、生化遺傳學
四、分子種群遺傳學
五、功能基因
六、組學
第二節(jié) 遺傳改良研究
一、雜交育種
二、選擇育種
三、分子標記輔助育種
四、雌核發(fā)育育種
五、多倍體育種
第三節(jié) 種質資源保護存在的問題及保護策略
一、種質資源保護存在的問題
二、種質資源保護策略
第二章 團頭魴種質資源
**節(jié) 團頭魴形態(tài)學特征
一、梁子湖團頭魴雌雄生長特征
二、梁子湖、鄱陽湖和淤泥湖團頭魴的形態(tài)學比較
三、團頭魴形態(tài)性狀對體重的影響效果分析
第二節(jié) 群體遺傳結構
一、線粒體基因組
二、微衛(wèi)星標記
三、相關序列擴增多態(tài)性
第三章 團頭魴分子標記的開發(fā)與應用
**節(jié) 微衛(wèi)星分子標記的開發(fā)
一、群體構建及測序分析
二、微衛(wèi)星分布特征及EST-SSR標記的開發(fā)
三、微衛(wèi)星多重PCR體系的構建
第二節(jié) SNP標記的開發(fā)
一、基于轉錄組測序的SNP標記開發(fā)
二、基于簡化基因組測序的SNP標記開發(fā)
第三節(jié) 基于微衛(wèi)星標記的親子鑒定
一、家系構建及親子鑒定方法
二、親子鑒定結果與分析
第四章 團頭魴經(jīng)濟性狀的遺傳參數(shù)評估
**節(jié) 團頭魴經(jīng)濟性狀的遺傳力評估
一、生長性狀
二、抗病性狀
第二節(jié) 生長性狀的育種值評估
一、個體單個性狀的育種值估算
二、個體綜合育種值
第三節(jié) 親本對子代生長快和生長慢群體的貢獻及優(yōu)良親本選擇
一、生長快和生長慢群體的生長表型
二、親子鑒定分析
三、親本對生長快和生長慢群體的貢獻分析
四、有效群體數(shù)量
五、親本育種值分析
第四節(jié) 不同地理群體間雜交優(yōu)勢和配合力分析
一、6月齡生長性狀
二、20月齡生長性狀
第五章 團頭魴性狀關聯(lián)分子標記的篩選
**節(jié) 生長性狀相關的分子標記
一、生長性狀關聯(lián)微衛(wèi)星標記篩選
二、生長性狀的QTL定位
第二節(jié) 抗病性狀相關的分子標記
一、MHC Ⅱ a基因序列的測定與SNP分析
二、轉鐵蛋白Tf及其受體TfR1-a基因SNP開發(fā)、鑒定及抗病關聯(lián)分析
三、NLRC3-like基因的SNP開發(fā)、鑒定及抗病關聯(lián)分析
第三節(jié) 耐低氧性狀相關的分子標記
一、基于轉錄組的低氧相關SNPs的開發(fā)
二、fih-1基因耐低氧性狀SNPs的開發(fā)
第六章 團頭魴新品種華海1號的選育
**節(jié) 華海1號的選育過程
第二節(jié) 華海1號的遺傳進展及穩(wěn)定性分析
一、遺傳進展分析
二、染色體遺傳穩(wěn)定性
三、群體遺傳一致性
第三節(jié) 華海1號的養(yǎng)殖性能分析
一、歷年對比試驗結果
二、歷年生產(chǎn)性能對比試驗結果
第七章 團頭魴三倍體和雌核發(fā)育的誘導及鑒定
**節(jié) 三倍體的誘導及鑒定
一、誘導方法
二、倍性的鑒定
第二節(jié) 團頭魴雌核發(fā)育的誘導及形態(tài)特征的分析
一、誘導方法
二、誘導結果及鑒定分析
第三節(jié) 雌核發(fā)育群體的微衛(wèi)星分析
一、微衛(wèi)星對雌核發(fā)育子代的鑒定
二、雌核發(fā)育后代純合性的評價
三、團頭魴正常群體和雌核發(fā)育群體微衛(wèi)星位點的遺傳多樣性分析
第八章 團頭魴全基因組測序及比較研究
**節(jié) 團頭魴全基因組測序與進化分析
一、團頭魴全基因組測序
二、團頭魴全基因組進化分析
第二節(jié) 高密度遺傳連鎖圖譜的構建
一、群體的建立及遺傳連鎖圖譜構建的方法
二、RAD測序數(shù)據(jù)分析
三、SNP分子標記發(fā)掘與基因分型
四、高密度遺傳連鎖圖譜的構建
第三節(jié) 不同食性魚類內源性消化系統(tǒng)的比較基因組學研究
一、內源性消化酶基因家族分析
二、嗅覺基因家族分析
三、味覺受體基因家族結果分析
第九章 團頭魴功能基因組的研究
**節(jié) 生長性狀相關的組學分析
一、生長性狀相關的轉錄組分析
二、生長性狀相關的小RNA組分析
第二節(jié) 抗病性狀相關的轉錄組分析
一、細菌感染后團頭魴肝臟的轉錄組學研究
二、細菌感染后團頭魴肝臟、脾臟、腎臟混合組織轉錄組學研究
三、細菌感染后團頭魴肝臟小RNA組學研究
第三節(jié) 耐低氧性狀相關的轉錄組分析
第四節(jié) 肌間骨性狀相關的組學分析
一、不同組織轉錄組分析
二、不同組織miRNA組分析
第十章 團頭魴性狀相關基因的結構和功能分析
**節(jié) 生長相關基因
一、生長相關基因的克隆
二、生長相關基因對其生長發(fā)育的表達調控
第二節(jié) 免疫相關基因
一、Toll樣受體基因
二、熱激蛋白基因
三、MHC Ⅱ基因
四、干擾素調節(jié)因子
五、白細胞介素6的表達及其啟動子活性分析
六、補體系統(tǒng)基因
七、鐵代謝相關基因
第三節(jié) 耐低氧相關基因
一、低氧感受基因——phd和fih
二、低氧響應基因——Hif-α家族
第四節(jié) 其他相關基因
一、ghrelin、NPY和CCK基因
二、團頭魴MRF家族基因的序列特征和功能分析
三、Dmrt家族基因
主要參考文獻