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常用生物數據分析軟件-(含光盤)

包郵 常用生物數據分析軟件-(含光盤)

出版社:科學出版時間:2008-05-01
開本: 16開 頁數: 364
本類榜單:自然科學銷量榜
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常用生物數據分析軟件-(含光盤) 版權信息

常用生物數據分析軟件-(含光盤) 本書特色

本書較為系統全面地介紹了生物信息學分析各個方面的軟件用法,結合光盤具體實例,方便使用?全書共分8章,內容包括:Unix/Linux操作系統介紹,介紹了基本的Unix/Linux操作命令;數據的基本處理,介紹了如何處理常用的生物信息學數據;序列的比對,介紹了常用比對軟件的用法及其在應用過程中要注意的問題;基因組/基因的注釋,介紹了Coding和Non唱Codoing基因的預測方法;SNP分析,介紹了常用的從生物學數據中尋找SNP的軟件;進化分析專題,介紹了幾種分子進化分析軟件,內容涉及進化樹的構建?Ka/Ks的計算等;基因表達分析專題,介紹了EST及生物芯片分析的流程和方法;蛋白質結構預測,介紹了蛋白質三維結構預測的流程及方法?

常用生物數據分析軟件-(含光盤) 內容簡介

本書較為系統全面地介紹了生物信息學分析各個方面的軟件用法,結合光盤具體實例,方便使用。全書共分8章,內容包括:Unix/Linux操作系統介紹,介紹了基本的Unix/Linux操作命令;數據的基本處理,介紹了如何處理常用的生物信息學數據;序列的比對,介紹了常用比對軟件的用法及其在應用過程中要注意的問題;基因組/基因的注釋,介紹了Coding和Non-Codoing基因的預測方法;SNP分析,介紹了常用的從生物學數據中尋找SNP的軟件;進化分析專題,介紹了幾種分子進化分析軟件,內容涉及進化樹的構建、Ka/Ks的計算等;基因表達分析專題,介紹了EST及生物芯片分析的流程和方法;蛋白質結構預測,介紹了蛋白質三維結構預測的流程及方法。   本書適合于生物信息學專業本科生及研究生使用。

常用生物數據分析軟件-(含光盤) 目錄

序前言第1章 Unix/Linux操作系統介紹 1.1 遠程登錄 1.2 文件的復制、刪除和移動命令 1.3 目錄的創建、刪除及更改目錄命令 1.4 文本查看命令 1.5 文本處理命令 1.6 改變文件或目錄的權限命令 1.7 備份與壓縮命令 1.8 磁盤及系統管理 1.9 軟件安裝簡介 1.10 其他第2章 數據的基本處理 2.1 數據常用格式介紹 2.2 測序原理介紹 2.3 華圖轉化(Phred) 2.4 文件轉換(phd2fasta) 2.5 載體屏蔽(cross_match) 2.6 序列聚類拼接 2.7 Consed 2.8 引物設計(Primer3) 主要參考文獻第3章 序列的比對 3.1 全局比對 3.2 局部比對 主要參考文獻第4章 基因組/基因的注釋 4.1 重復序列分析 4.2 RNA分析 4.3 基因預測 4.4 基因功能注釋 主要參考文獻第5章 SNP分析 5.1 Polyphred 5.2 SNPdetector 5.3 cross_match 主要參考文獻第6章 進化分析專題 6.1 Phylip 6.2 Paml 6.3 KaKs_Calculator 6.4 FGF 6.5 MEGA 主要參考文獻第7章 基因表達分析專題 7.1 EST表達序列標簽分析 7.2 生物芯片分析 7.3 Motif預測 主要參考文獻第8章 蛋白質結構預測 8.1 蛋白質結構知識介紹 8.2 蛋白質結構預測方法 8.3 蛋白質結構預測的Threading方法 8.4 蛋白質三維結構預測流程介紹 主要參考文獻
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