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包郵 生物信息學

出版社:浙江大學出版社出版時間:2017-09-01
開本: 32開 頁數: 517頁
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生物信息學 版權信息

生物信息學 本書特色

本書閱讀對象為本科、研究生和從事生物學及其相關專業領域(如醫學、農
學等)科研與開發人員等,可以作為生物信息學專業學生的入門教材和非生物信
息學專業學生和科研工作者的基礎教材。本書共分為四部分:生物信息學基礎
(*篇)、高通量測序數據分析(第二篇)、生物信息學外延與交叉(第三篇)和生
物信息學資源與實踐(第四篇)。各篇內容:(1)作為生物信息學的基礎篇,*
篇包括8章內容,涵蓋序列數據產生、分子數據庫、序列聯配算法、基因預測、系統
發生樹構建和蛋白質結構預測等。同時也涵蓋了生物信息學計算機基礎部分,
包括操作系統、主要編程語言等。該篇主要目的是使初學者掌握生物信息學的
基本概念和主要方法。(2)第二篇為高通量序列數據分析,主要針對目前第二代本書閱讀對象為本科、研究生和從事生物學及其相關專業領域(如醫學、農
學等)科研與開發人員等,可以作為生物信息學專業學生的入門教材和非生物信
息學專業學生和科研工作者的基礎教材。本書共分為四部分:生物信息學基礎
(*篇)、高通量測序數據分析(第二篇)、生物信息學外延與交叉(第三篇)和生
物信息學資源與實踐(第四篇)。各篇內容:(1)作為生物信息學的基礎篇,*
篇包括8章內容,涵蓋序列數據產生、分子數據庫、序列聯配算法、基因預測、系統
發生樹構建和蛋白質結構預測等。同時也涵蓋了生物信息學計算機基礎部分,
包括操作系統、主要編程語言等。該篇主要目的是使初學者掌握生物信息學的
基本概念和主要方法。(2)第二篇為高通量序列數據分析,主要針對目前第二代
和第三代測序技術產生的核苷酸序列數據,涵蓋基于高通量測序數據的基因組
拼接、基因組變異、轉錄組、非編碼RNA、甲基化和宏基因組等生物信息學分析原
理和技術。(3)第三篇為生物信息學外延與交叉,介紹了與生物信息學緊密相關
的四個生物學領域:系統生物學、群體遺傳學、數量遺傳學和合成生物學。(4)*
后一篇為生物信息學資源與實踐篇,主要羅列了生物信息學主要相關術語、專業
詞匯、數據庫和公開軟件等資源,并提供了8個生物信息學實驗課程內容。上述
*篇和第四篇內容建議作為本科教學的基本內容,第二篇和第三篇可以作為
研究生和生物信息學專業學生教學內容。

生物信息學 內容簡介

本書閱讀對象為本科、研究生和從事生物學及其相關專業領域(如醫學、農 學等)科研與開發人員等,可以作為生物信息學專業學生的入門教材和非生物信 息學專業學生和科研工作者的基礎教材。本書共分為四部分:生物信息學基礎 (一篇)、高通量測序數據分析(第二篇)、生物信息學外延與交叉(第三篇)和生 物信息學資源與實踐(第四篇)。各篇內容:(1)作為生物信息學的基礎篇,一 篇包括8章內容,涵蓋序列數據產生、分子數據庫、序列聯配算法、基因預測、系統 發生樹構建和蛋白質結構預測等。同時也涵蓋了生物信息學計算機基礎部分, 包括操作系統、主要編程語言等。該篇主要目的是使初學者掌握生物信息學的 基本概念和主要方法。(2)第二篇為高通量序列數據分析,主要針對目前第二代 和第三代測序技術產生的核苷酸序列數據,涵蓋基于高通量測序數據的基因組 拼接、基因組變異、轉錄組、非編碼RNA、甲基化和宏基因組等生物信息學分析原 理和技術。(3)第三篇為生物信息學外延與交叉,介紹了與生物信息學緊密相關 的四個生物學領域:系統生物學、群體遺傳學、數量遺傳學和合成生物學。(4) 后一篇為生物信息學資源與實踐篇,主要羅列了生物信息學主要相關術語、專業 詞匯、數據庫和公開軟件等資源,并提供了8個生物信息學實驗課程內容。上述 一篇和第四篇內容建議作為本科教學的基本內容,第二篇和第三篇可以作為 研究生和生物信息學專業學生教學內容。

生物信息學 目錄

緒論 **節 生物信息與生物信息學 一、迅速增長的生物信息 二、生物信息學的概念 第二節 生物信息學簡史與展望 一、生物信息學發展簡史 二、生物信息學技術的應用 三、生物信息學學科展望 第三節 本書的組織與使用 ***篇 生物信息學基礎 第1-1章 生物信息類型及其產生途徑 **節 生物信息的類型 第二節 DNA測序技術 一、**代測序技術 二、第二代測序技術 三、第三代測序技術 第三節 高通量測序技術的應用 一、DNA/RNA相關測序 二、蛋白質一DNA/RNA互作測序 三、甲基化/宏基因組測序 第四節 蛋白質序列及其結構測定 一、蛋白質序列與蛋白質互作測定 二、蛋白質結構測定 第1-2章 分子數據庫 **節 分子數據庫概述 一、分子數據庫概念 二、數據庫記錄格式 三、數據庫冗余、序列遞交和檢索 第二節 核苷酸及其相關數據庫 一、DNA/RNA序列數據庫 二、基因組數據庫 三、非編碼RNA數據庫 第三節 蛋白質及其相關數據庫 第四節 代謝途徑等專業數據庫 一、代謝途徑數據庫 二、代謝組學數據庫和表型數據庫 第1-3章 兩條序列聯配算法及序列搜索 **節 序列聯配基本概念 第二節計分矩陣 一、計分矩陣的一般原理 二、氨基酸替換矩陣 三、位置特異性計分矩陣(PSSM) 第三節 兩條序列聯配算法 一、Needleman-Wunsch算法 二、Smith-WaterTnan算法 第四節 BLAST算法及數據庫搜索 一、BLAST算法 二、利用BLAST 進行數據庫序列搜索 三、序列相似性的統計推斷 第1-4章 多條序列聯配算法及功能域分析 **節 多序列聯配概念及其算法 一、多序列聯配概念 二、多序列全局聯配算法 三、多序列局部聯配算法 第二節 蛋白質序列功能域分析與模型 一、功能域概念 二、功能域模型 第三節 熵與信息量 一、不確定性與信息量 二、信息熵的應用 第1-5章 基因預測與功能注釋 **節 基因組序列構成與基因預測 一、基因組序列的基本構成 二、基因預測及其基本方法 …… 第1-6章 系統發生樹構建 第1-7章 蛋白質結構預測與藥物設計 第1-8章 生物信息學計算機基礎 *第二篇 高通量測序數據分析 第2-1章 基因組拼接與分析 第2-2章 基因組變異與分析 第2-3章 轉錄組分析 第2-4章 非編碼RNA分析 第2-5章 甲基化與組蛋白修飾分析 第2-6章 宏基因組分析 第2-7章 蛋白質組分析 *第三篇 生物信息學外延與交叉 第3一1章 系統生物學 第3-2章 群體遺傳學 第3-3章 數量遺傳學 第3-4章 合成生物學 *第四篇 生物信息學資源與實踐 第4-1章 生物信息學常用代碼和關鍵詞 第4-2章 生物信息學數據庫和在線分析工具 第4-3章 生物信息學實驗 第4-4章 生物信息學常用英文術語及釋義 參考文獻
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生物信息學 作者簡介

樊龍江 浙江大學生物信息學研究所和作物科學研究所教授,生物信息學和作物遺傳育種專業博士生導師。教育部“新世紀優秀人才支持計劃”獲得者,浙江省生物信息學學會副理事長,德國DAAD訪問學者。自2000年起,直接參與浙江大學生物信息學學科籌建,為浙江大學第一批生物信息學專業導師。

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