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包郵 分子系統發生學

作者:黃原
出版社:科學出版社出版時間:2012-06-01
開本: 16開 頁數: 533
本類榜單:自然科學銷量榜
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分子系統發生學 版權信息

分子系統發生學 本書特色

分子系統發育學(molecularphylogenetics)是研究利用生物大分子(主要是DNA和蛋白質)數據構建系統樹的原理、方法和實踐的一門交叉學科。本書全面系統地論述了分子系統發育學的原理、方法及應用。全書由三部分共15章組成。*部分的5章是分子系統發育學的基礎,分別介紹了分子系統發育學和系統樹的概念、發展簡史、基本原理以及序列比對和系統發育信息學。第二部分的9章分別詳細介紹了目前常用的各種系統發育分析方法,包括距離矩陣法、簡約法、*似然法、貝葉斯法、系統發育網絡和超樹等方法,每一類方法都從原理、步驟、軟件等方面進行詳細地介紹。第三部分全面系統地介紹了分子系統樹在生物學研究中的應用。

分子系統發生學 內容簡介

分子系統發育學(molecularphylogenetics)是研究利用生物大分子(主要是DNA和蛋白質)數據構建系統樹的原理、方法和實踐的一門交叉學科。本書全面系統地論述了分子系統發育學的原理、方法及應用。全書由三部分共15章組成。**部分的5章是分子系統發育學的基礎,分別介紹了分子系統發育學和系統樹的概念、發展簡史、基本原理以及序列比對和系統發育信息學。第二部分的9章分別詳細介紹了目前常用的各種系統發育分析方法,包括距離矩陣法、簡約法、*大似然法、貝葉斯法、系統發育網絡和超樹等方法,每一類方法都從原理、步驟、軟件等方面進行詳細地介紹。第三部分全面系統地介紹了分子系統樹在生物學研究中的應用。

分子系統發生學 目錄

前言第1章 系統發生學概論1.1 系統發生與系統發生學1.2 系統發生關系的含義1.2.1 表征關系1.2.2 分支關系1.2.3 遺傳關系1.2.4 系統發生關系1.2.5 年代關系1.2.6 地理分布關系1.3 分子系統發生分析的原理和假設1.3.1 分子系統發生分析的原理1.3.2 分子系統發生分析的假設1.3.3 分子數據的優點1.4 分子系統發生學的方法論1.5 分子系統發生學的發展歷史1.6 系統發生分析的策略與步驟1.7 分子系統發生學的文獻資源1.7.1 分子系統發生學期刊1.7.2 分子系統發生學領域主要專著和教科書1.8 分子系統發生學的成就和問題 第2章 系統發生分析基礎2.1 分子進化基礎2.1.1 分子進化的動力2.1.2 分子進化的中性理論2.1.3 溯祖理論2.2 系統發生分析的分類學基礎2.2.1 系統發生與分類學的關系2.2.2 分類階元的系統發生意義2.3 性狀和性狀分析方法2.3.1 性狀的分類2.3.2 關于性狀的基本假設2.3.3 性狀進化分析方法2.3.4 性狀的加權2.3.5 性狀的同源2.3.6 性狀的同型2.4 系統發生分析的數學基礎2.5 系統發生分析的統計學基礎2.5.1 概率分布2.5.2 系統發生的統計學檢驗2.5.3 零假設與零模型2.5.4 常用檢驗方法2.5.5 隨機數據及其在系統發生中的應用2.6 理論系統發生學2.7 模擬系統發生研究2.7.1 系統樹的模擬2.7.2 序列的模擬2.7.3 系統發生模擬研究的優勢2.8 系統發生分析的算法2.8.1 精確算法2.8.2 啟發式算法第3章 系統樹3.1 系統樹的概念和含義3.2 系統樹的要素3.2.1 系統樹的拓撲結構3.2.2 系統樹的節點3.2.3 系統樹的分枝和分枝長度3.3 演化歷史與系統樹的完整性3.4 系統樹表達的信息3.5 系統樹概念和表達形式的發展3.6 系統樹的類型3.6.1 樹狀圖與網狀圖3.6.2 有根樹和無根樹3.6.3 標度樹與未標度樹3.6.4 基因樹和物種樹3.6.5 基礎樹和合一樹、源樹和超樹3.6.6 期望樹與實際樹3.6.7 普適生命樹與完全樹3.6.8 二歧樹和多歧樹3.6.9 系統樹的表示形式3.7 系統樹的數學描述3.7.1 系統樹各部位的名稱3.7.2 二分樹及其表示方式3.7.3 二歧樹的性質…… 第4章 系統發生信息學第5章 數據集準備與序列比對第6章 數據集系統發生信號評估第7章 進化模型及其選擇第8章 距離矩陣方法第9章 簡約法第10章 *大似然法第11章 貝葉斯系統發生推論法第12章 系統發生網絡、超樹和無比對方法第13章 系統發生假設檢驗第14章 系統發生分析的可靠性與影響因素第15章 不同類型數據的分析策略第16章 復雜數據和困難系統發生的分析策略與方法第17章 多源數據集分析策略和方法第18章 系統樹的可視化、注釋與應用參考文獻彩圖
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分子系統發生學 作者簡介

黃原:陜西師范大學教授,主要從事昆蟲的分子進化和分子系統學、線粒體基因組學、比較及進化基因組學等方向的研究。陜西科技進步一等獎獲得者。

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