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直翅目昆蟲線粒體基因組的比較及譜系基因組學分析 版權信息
- ISBN：9787567433991
- 條形碼：9787567433991 ; 978-7-5674-3399-1
- 裝幀：一般膠版紙
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>
直翅目昆蟲線粒體基因組的比較及譜系基因組學分析 內容簡介
本書對線粒體基因組數據的獲取、基因組的組裝和注釋方法進行了概述，并對基于一代測序和高通量測序測定46個直翅目物種的線粒體基因組的研究工作進行總結，以蝗總科的異歧蔗蝗、無齒稻蝗的線粒體基因組序列為例，對直翅目物種線粒體基因組的結構、堿基組成、氨基酸的使用、密碼子使用頻率、RNA二級結構、控制區特征等方面進行簡單介紹。然后從比較基因組學角度對直翅目142個物種的mtDNA序列的大小、基因重排、堿基組成、密碼子使用、氨基酸組成等方面進行比較分析。再從譜系基因組學角度利用直翅目171個物種的mtDNA數據進行了異質性、替換飽和等方面的分析，并通過數據劃分選擇模型構建系統發生樹，對直翅目物種系統發生進行探討。直翅目線粒體基因組數據的增加，將會為研究線粒體基因組進化特征和構建更加穩健的系統發生關系提供新數據，為構建更加穩健的直翅目系統發生關系和研究mtDNA進化特征提供新支撐。
直翅目昆蟲線粒體基因組的比較及譜系基因組學分析 目錄
第1章緒論
1.1線粒體及線粒體基因組簡介
1.2線粒體基因組研究策略及方法
1.3比較基因組學
1.4譜系基因組學
1.5直翅目系統發生中存在的問題
第2章線粒體基因組組裝與注釋
2.DNA的提取及質量檢測
2.2基于PCR擴增和一代測序的mtDNA測定方法
2.3基于高通量測序的mtDNA測定方法
2.4線粒體基因組的注釋
2.5線粒體基因組組成分析
第3章直翅目線粒體基因組測定和分析實例
3.1試驗材料與方法
3.DNA提取、測序、組裝及注釋
3.3線粒體基因組組成與分析
第4章直翅目線粒體比較基因組學分析
4.1線粒體基因組大小
4.2線粒體基因組基因重排
4.3線粒體基因組的間隔區和重疊區
4.4線粒體基因組基因長度的變化
4.5線粒體基因組堿基組成
4.6線粒體基因組密碼子組成
4.7線粒體基因組氨基酸組成
4.8線粒體基因組tRNA基因與rRNA基因
4.9線粒體基因組D-Loop區比較
第5章直翅目線粒體譜系基因組學分析
5.1數據來源
5.2數據集的構建與評估
5.化模型選擇
5.4系統發生樹的構建
5.5直翅目線粒體譜系基因組學分析結果與討論
參考文獻
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