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宏基因組學:方法與步驟(原書第二版) 版權信息
- ISBN:9787030757951
- 條形碼:9787030757951 ; 978-7-03-075795-1
- 裝幀:平裝膠訂
- 冊數:暫無
- 重量:暫無
- 所屬分類:>>
宏基因組學:方法與步驟(原書第二版) 內容簡介
本書共包括19個章節,詳細介紹了不同類型環境樣本的DNA/RNA提取、以及宏基因組文庫構建技術,包括海水環境、低溫及堿性特別環境、植物內生環境等;并從核酸、脫氧核酸、蛋白質三個角度分析環境微生物代謝活性;介紹了通過宏基因組測序獲得功能基因的分類及多樣性的方法,并從基因組學技術層面介紹了復雜微生物群落的研究方法,以及如何挖掘活性基因(如有機物降解基因)并介紹其表達技術與工具,高通量地篩選活性酶基因如水解酶、纖維素酶、新型PHA代謝酶、磷酸酶、氫化酶、N-AHSL干擾酶等;并介紹如何挖掘增加微生物次級代謝的信號。
宏基因組學:方法與步驟(原書第二版) 目錄
前言
貢獻者
第1章 構建小插入片段和大插入片段的宏基因組文庫
1.1 介紹
1.2 實驗材料
1.2.1 宏基因組DNA
1.2.2 小片段文庫構建
1.2.3 大片段文庫構建
1.3 實驗方法
1.3.1 小片段宏基因組文庫構建
1.3.2 大片段宏基因組文庫構建
1.4 注釋
參考文獻
第2章 從海洋過濾樣本提取總DNA與RNA及用于標記基因研究的cDNA通用模板的制備
2.1 介紹
2.2 實驗材料
2.2.1 浮游細菌樣品
2.2.2 DNA與RNA同時提取
2.2.3 提取的DNA與RNA純化
2.2.4 DNA消化和PCR對照
2.2.5 **鏈和第二鏈合成
2.3 實驗方法
2.3.1 從海水濾膜樣品中同時提取DNA與RNA
2.3.2 純化DNA與RNA
2.3.3 **鏈和第二鏈合成
2.4 注釋
參考文獻
第3章 海洋宏基因組大片段文庫的構建與篩選
3.1 介紹
3.2 實驗材料
3.2.1 取樣
3.2.2 宏基因組DNA的分離
3.2.3 16S rDNA系統發生分析
3.2.4 構建宏基因組大片段文庫
3.2.5 從宏基因組文庫篩選具有群體感應抑制活性的基因
3.3 實驗方法
3.3.1 取樣流程
3.3.2 宏基因組DNA分離
3.3.3 16S擴增子測序
3.3.4 大片段文庫構建
3.3.5 采用PCR擴增對宏基因組文庫進行基于序列的篩選
3.3.6 基于功能的宏基因組文庫篩選
3.4 注釋
參考文獻
第4章 寒冷和堿性極端環境宏基因組文庫的構建與篩選
4.1 介紹
4.2 實驗材料
4.2.1 完整的細胞提取和DNA提取
4.2.2 文庫構建
4.2.3 酶活性篩選
4.3 實驗方法
4.3.1 從伊卡巖柱樣品中獲取DNA
4.3.2 文庫構建
4.3.3 低溫和高pH條件下酶活性的篩選
4.3.4 宏基因組的偏差評估及酶潛力的檢測
4.4 注釋
參考文獻
第5章 基于DNA/RNA/蛋白質的穩定同位素探針技術用于活性微生物標志物的高通量分析
第6章 植物內生細菌和真菌的多樣性評估
第7章 通過宏基因組鳥槍法測序技術研究復雜微生物群落中的植物軟腐病腸桿菌科病原菌
第8章 來源于宏基因組的基因在變鉛青鏈霉菌中的克隆、表達和發酵優化
第9章 基于宏基因組數據的降解網絡重建
第10章 宏基因組DNA功能表達的新工具
第11章 基于微孔板的活性和立體選擇性水解酶的篩選
第12章 基于宏基因組文庫的纖維素酶的篩選
第13章 利用對硝基苯基底物篩選宏基因組文庫中輔助性木質纖維素酶的液相復用高通量篩選技術
第14章 修飾多酚類底物的糖基轉移酶的篩選
第15章 從復雜微生物群落中分離編碼新型PHA代謝酶基因的方法
第16章 基于功能宏基因組文庫的磷酸酶活性編碼基因的篩選和異源表達
第17章 基于活性宏基因組文庫的氫化酶篩選
第18章 基于N-AHSL信號的干擾酶篩選
第19章 挖掘微生物信號分子助力次級代謝產物的生物探索
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