包郵駱駝基因組學研究

作者：吳慧光

出版社：中國農業科學技術出版社出版時間：2016-12-01

開本： 16開 頁數： 176

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版權信息
本書特色
內容簡介
目錄
作者簡介

駱駝基因組學研究版權信息

ISBN：9787511636416
條形碼：9787511636416 ; 978-7-5116-3641-6
裝幀：一般膠版紙
冊數：暫無
重量：暫無
所屬分類：
自然科學
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動物學

駱駝基因組學研究本書特色

阿拉善雙峰駝基因組學研究一書重點介紹了阿拉善雙峰駝飼養特點，從阿拉善雙峰駝基因組和宏基因組不同的研究方法角度，分析阿拉善雙峰駝*基因組和第二基因組的特點，為實現阿拉善雙峰駝遺傳資源的開發提供理論指導。

駱駝基因組學研究內容簡介

阿拉善雙峰駝基因組學研究一書重點介紹了阿拉善雙峰駝飼養特點，從阿拉善雙峰駝基因組和宏基因組不同的研究方法角度，分析阿拉善雙峰駝**基因組和第二基因組的特點，為實現阿拉善雙峰駝遺傳資源的開發提供理論指導。

駱駝基因組學研究目錄

第1章引言

11研究背景和意義

12國內外研究進展

121駱駝科動物的進化

122現存駱駝科動物的生物學特性

123生物信息學及其發展歷史

124基因組測序技術

13研究內容

第2章駱駝科動物全基因組序列的測序與組裝

21材料與方法

211試驗材料

212DNA提取及檢測

213基因組測序

214測序數據過濾

215K-mer分析估計基因組大小

216小片段數據糾錯

217駱駝科動物基因組的組裝

218駱駝科動物基因組的測序效果評價

22 結果與分析

221DNA樣品檢測結果

222基因組測序結果

223測序數據過濾結果

224K-mer分析估計基因組大小的結果

225小片段數據糾錯的結果

2263個駱駝科動物基因組的組裝結果

2273個駱駝科動物基因組的組裝后基因組分析

23討論

231測序物種的選擇

232測序平臺與策略

233基因組大小的估計

234基因組的組裝指標

24本章小結

第3章駱駝科動物的基因組注釋

31材料與方法

311試驗材料

312重復序列注釋

313基因預測

314功能注釋

315ncRNA注釋

316基因集評估

317直系同源關系分析

32結果與分析

321重復序列注釋統計結果

322基因預測統計結果

323功能注釋統計結果

324ncRNA注釋統計結果

325基因集評估統計結果

326直系同源關系分析結果

33討論

331駱駝科動物基因組重復序列的注釋

332駱駝科動物基因組基因結構的預測

333駱駝科動物基因組基因功能和非編碼RNA的注釋

34本章小結

第4章駱駝科動物基因組進化分析

41材料與方法

411試驗材料

412共線性鑒定

413片段復制分析

414基因家族聚類分析

415物種進化樹的構建

416物種分歧時間的計算

417分支特異性Ka/Ks率計算

418SNP判讀和分布比較分析

419群體歷史重建

42結果與分析

421共線性鑒定結果

422片段復制分析結果

423基因家族聚類分析結果

424物種進化樹的構建結果

425物種分歧時間的計算結果

426分支特異性Ka/Ks率計算結果

427SNP判讀和分布比較分析結果

428群體歷史重建結果

43討論

431駱駝科動物基因組的共線性與片段復制

432駱駝科動物進化關系和分歧時間推算

433駱駝科動物的選擇壓力

434駱駝科動物的群體歷史規模的變化

44本章小結

第5章駱駝沙漠適應性的比較基因組學分析

51材料與方法

511試驗材料

512基因家族收縮擴張分析

513正選擇分析

514包含特異氨基酸變異的蛋白篩查

515基因獲得和缺失

516快速進化

52結果與分析

521基因家族收縮擴張分析結果

522正選擇分析結果

523包含特異氨基酸變異的蛋白篩查結果

524基因獲得和缺失結果

525快速進化基因結果

53討論

531駱駝能量代謝

532駱駝應激能力

533駱駝對沙塵和日照的適應性

534駱駝對缺水的適應性

54本章小結

第6章雙峰駝腎臟的轉錄組分析

61材料與方法

611試驗材料及試驗處理

612RNA提取及檢測

613RNA樣品處理與測序

614轉錄組數據過濾

615基因表達水平計算

616差異表達基因篩選

617差異表達基因的GO功能顯著性富集分析

618差異表達基因的通路顯著性富集分析

62結果與分析

621RNA提取檢測結果

622轉錄組測序的堿基組成和堿基質量分析結果

623雙峰駝腎臟轉錄組基本分析結果

624雙峰駝腎臟轉錄組基因表達注釋結果

625雙峰駝腎臟轉錄組基因差異表達分析結果

626雙峰駝腎臟轉錄組差異表達基因的GO分析結果

627雙峰駝腎臟轉錄組差異表達基因的通路富集分析結果

63討論

631駱駝腎臟鈉重吸收相關基因的轉錄特點

632駱駝腎臟水孔蛋白基因家族轉錄特點

633駱駝腎臟的高滲調節特點

634駱駝腎髓質有機適應性滲透物的調節

635駱駝腎髓質的滲透調節與血糖

636駱駝腎髓質的滲透保護

64本章小結

第7章全書總結

71全書結論

72研究創新點

73有待進一步研究的內容

731基因組組裝版本的更新

732基因組注釋工作的完善

733駱駝科動物進化基因的研究

734駱駝腎臟生理的分子和細胞學研究

縮略詞表

附錄

參考文獻

展開全部

駱駝基因組學研究作者簡介

吳慧光，男，1980年生，博士，現美國俄亥俄州立大學博士后，主要從事阿拉善雙峰駝基因組學研究。主持國家級項目1項，省級項目2項，校級項目2項，參加項目多項。發表論文多篇，其中第一作者發表《NatureCommunication》1篇。獲得市級獎勵2項，校級獎勵2項。

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