序前言**章 牡丹種質(zhì)資源研究 **節(jié) 牡丹種質(zhì)資源 一、牡丹野生種質(zhì)資源 二、牡丹栽培品種資源 第二節(jié) 牡丹種質(zhì)資源研究進(jìn)展 一、牡丹種質(zhì)資源研究方法 二、牡丹野生種質(zhì)資源親緣關(guān)系研究 三、栽培牡丹與野生種遺傳關(guān)系的研究 四、牡丹栽培品種研究 五、牡丹核心種質(zhì)研究 六、牡丹遺傳圖譜研究 第三節(jié) 牡丹DNA分子標(biāo)記研究意義第二章 DNA分子標(biāo)記技術(shù)概述 **節(jié) DNA分子標(biāo)記類型 一、基于Southem雜交的分子標(biāo)記 二、基于PCR技術(shù)的分子標(biāo)記 三、基于DNA序列和芯片的分子標(biāo)記 第二節(jié) 主要DNA分子標(biāo)記技術(shù)多態(tài)性原理及在牡丹中的應(yīng)用 一、基于通用引物的DNA分子標(biāo)記 二、基于重復(fù)序列的分子標(biāo)記多態(tài)性原理 三、基于反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的。DNA分子標(biāo)記多態(tài)性原理第三章 DNA分子標(biāo)記實(shí)驗(yàn)技術(shù) **節(jié) 牡丹基因組DNA的提取 一、改良CTAB法提取牡丹基因組DNA 二、SDS法提取牡丹基因組DNA 三、月桂;“彼徕c提取牡丹基因組DNA 四、牡丹基因組DNA的快速提取方法 第二節(jié) 牡丹DNA的定量與純度檢測(cè) 一、紫外光譜分析 二、二苯胺顯色法分析 三、瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) 四、Nanodtop測(cè)定DNA:濃度 五、Oubit測(cè)定DNA濃度 第三節(jié) 引物設(shè)計(jì) 一、引物設(shè)計(jì)的主要步驟 二、引物設(shè)計(jì)原則 第四節(jié) 聚合酶鏈反應(yīng) 一、PCR操作步驟 二、PCR反應(yīng)體系的組成與反應(yīng)條件的優(yōu)化 第五節(jié) 牡丹DNA分子標(biāo)記電泳檢測(cè)方法 一、瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) 二、聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè) 三、DNA銀染 第六節(jié) 序列的克隆方法 一、擴(kuò)增產(chǎn)物的回收與純化 二、LB固、液培養(yǎng)基的制備 三、大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的制備 四、回收產(chǎn)物的克隆和轉(zhuǎn)化 五、大腸桿菌質(zhì)粒的提取及陽(yáng)性菌檢測(cè)第四章 牡丹隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA分子標(biāo)記 **節(jié) RAPD分子標(biāo)記技術(shù)概述 一、RAPD分子標(biāo)記技術(shù)原理 二、RAPD分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 第二節(jié) RAPD分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 一、RAPD在植物研究中的應(yīng)用 二、RAPD在牡丹研究中的應(yīng)用第五章 牡丹擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性分子標(biāo)記 **節(jié) AFLP分子標(biāo)記技術(shù)概述 一、AFLP分子標(biāo)記技術(shù)原理 二、AFLP分子標(biāo)記關(guān)鍵技術(shù) 三、AFLP分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 第二節(jié) AFLP分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 一、AFLP分子標(biāo)記在植物研究中的應(yīng)用 二、AFLP分子標(biāo)記在牡丹研究中的應(yīng)用 第三節(jié) 牡丹品種遺傳多樣性的AFLP分析 一、材料與方法 二、不同引物組合擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性 三、聚類分析 四、AFLP指紋圖譜的特征和不同引物組合的檢測(cè)效率 五、討論第六章 牡丹相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記 **節(jié) SRAP分子標(biāo)記技術(shù)概述 一、SRAP分子標(biāo)記技術(shù)原理 二、SRAP分子標(biāo)記關(guān)鍵技術(shù) 三、SRAP分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 第二節(jié) SRAP分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 一、SRAP分子標(biāo)記在植物研究中的應(yīng)用 二、SRAP分子標(biāo)記在牡丹研究中的應(yīng)用 第三節(jié) 牡丹SRAPPCR反應(yīng)體系的建立 一、材料與方法 二、牡丹SRAP反應(yīng)體系的正交優(yōu)化結(jié)果 三、討論 第四節(jié) 不同花色牡丹品種親緣關(guān)系的SRAP分析 一、材料與方法 二、不同引物組合擴(kuò)增結(jié)果的多態(tài)性分析 三、聚類分析 四、主坐標(biāo)分析 五、討論第七章 牡丹目標(biāo)起始密碼子多態(tài)性分子標(biāo)記 **節(jié) SCoT分子標(biāo)記技術(shù)概述 一、SCoT分子標(biāo)記技術(shù)原理 二、SCoT分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 三、SCoT分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 第二節(jié) 牡丹SCoT分子標(biāo)記正交優(yōu)化及引物篩選 一、材料與方法 二、牡丹SCoT反應(yīng)體系的正交優(yōu)化分析 三、SCoT_PCR反應(yīng)體系穩(wěn)定性驗(yàn)證及引物的篩選 第三節(jié) 不同花色牡丹種質(zhì)資源SCoT分析 一、材料與方法 二、擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性分析 三、聚類分析 四、討論第八章 牡丹保守DNA衍生多態(tài)性分子標(biāo)記 **節(jié) CDDP分子標(biāo)記概述 一、CDDP分子標(biāo)記技術(shù)原理 二、CDDP分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 第二節(jié) CDDP分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 一、CDDP分子標(biāo)記在植物研究中的應(yīng)用 二、CDDP分子標(biāo)記在牡丹研究中的應(yīng)用第九章 牡丹簡(jiǎn)單重復(fù)序列分子標(biāo)記引物開(kāi)發(fā) **節(jié) 牡丹SSR分子標(biāo)記引物的開(kāi)發(fā)方法 一、數(shù)據(jù)庫(kù)查詢 二、磁珠富集法開(kāi)發(fā)SSR引物 三、二代測(cè)序技術(shù)開(kāi)發(fā)SSR引物 第二節(jié) 磁珠富集法開(kāi)發(fā)牡丹SSR標(biāo)記引物 一、材料與方法 二、微衛(wèi)星序列分離與分析 三、微衛(wèi)星引物設(shè)計(jì) 第三節(jié) 基于EST序列開(kāi)發(fā)牡丹SSR標(biāo)記引物 一、材料與方法 二、牡丹EST_SSR分析 三、牡丹EST_SSR引物的開(kāi)發(fā)與篩選第十章 牡丹簡(jiǎn)單重復(fù)序列分子標(biāo)記 **節(jié) SSR分子標(biāo)記技術(shù)概述 一、SSR分子標(biāo)記研究發(fā)展 二、SSR分子標(biāo)記技術(shù)原理 三、SSR分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 第二節(jié) SSR分子標(biāo)記研究與應(yīng)用 一、在植物研究中的應(yīng)用 二、牡丹基因紐中SSR分子標(biāo)記的頻率及分布 三、SSR分子標(biāo)記在牡丹研究中的應(yīng)用 第三節(jié) 不同牡丹種質(zhì)資源SSR評(píng)價(jià)分析 一、材料與方法 二、多態(tài)性SSR。引物的篩選 三、SSR擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性分析 四、聚類分析 五、討論第十一章 牡丹簡(jiǎn)單重復(fù)序列區(qū)間分子標(biāo)記 **節(jié) ISSR分子標(biāo)記概述 一、ISSR分子標(biāo)記技術(shù)原理 二、ISSR分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 第二節(jié) ISSR分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 一、ISSR分子標(biāo)記在植物研究中的應(yīng)用 二、ISSR分子標(biāo)記在牡丹研究中的應(yīng)用第十二章 牡丹反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子序列的分離**節(jié) 植物反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子 一、植物反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子概述 二、反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的類型及結(jié)構(gòu) 第二節(jié) 牡丹反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子L1R序列的分離 一、巢式PCR方法分離牡丹L,TR序列 二、利用iPBS方法分離牡丹反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子L11R序列 第三節(jié) 牡丹LINE類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子I盯序列的克隆及分析 一、材料與方法 二、PCR反應(yīng)體系及擴(kuò)增程序的優(yōu)化 三、牡丹LINE類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子RT序列的普遍存在性 四、牡丹LINE類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子RT序列的分析 五、牡丹LINE類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子RT序列聚類分析 六、討論- 第四節(jié) 植物L(fēng)TR類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子序列分析方法 一、LTR類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子序列的比對(duì)軟件 二、L1R類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子序列的識(shí)別鑒定軟件 三、LTR類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子分析識(shí)別流程 四、討論第十三章 牡丹序列特異擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記 **節(jié) SSAP分子標(biāo)記技術(shù)概述 一、SSAP分子標(biāo)記技術(shù)原理- 二、SSAP分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn)第二節(jié) 牡丹種質(zhì)資源SSAP分子標(biāo)記分析一、材料與方法二、引物篩選三、SSAP多態(tài)性分析四、SSAP聚類分析五、DNA指紋圖譜構(gòu)建六、討論第十四章 牡丹iPBS和RRSAP分子標(biāo)記 **節(jié) iPBS分子標(biāo)記概述 一、iPBS分子標(biāo)記技術(shù)特點(diǎn) 二、iPBS分子標(biāo)記的研究與應(yīng)用 第二節(jié) 牡丹組野生種(居群)和部分栽培種遺傳多樣性的iPBS分析 一、材料與方法 二、PCR擴(kuò)增結(jié)果 三、iPBS遺傳相似系數(shù)分析 四、iPBS聚類分析 五、討論 第三節(jié) 牡丹RRSAP分子標(biāo)記概述 第四節(jié) 部分牡丹種質(zhì)資源親緣關(guān)系的RRSAP分子標(biāo)記研究 一、材料與方法 二、引物篩選結(jié)果 三、RRSAP分子標(biāo)記多態(tài)性分析 四、RRSAP分子標(biāo)記相似系數(shù) 五、RRSAP分子標(biāo)記聚類分析 六、討論第十五章 其他分子標(biāo)記方法 **節(jié) 基于葉綠體DNA的分子標(biāo)記 一、葉綠體DNA的結(jié)構(gòu)和特點(diǎn) 二、基于葉綠體DNA的分子標(biāo)記及應(yīng)用 三、基于葉綠體DNA的分子標(biāo)記在牡丹中的應(yīng)用 第二節(jié) 基于核糖體DNA的分子標(biāo)記 一、核糖體DNA的結(jié)構(gòu)與特點(diǎn) 二、基于核糖體DNA的分子標(biāo)記在植物中的應(yīng)用 三、基于核糖體DNA的分子標(biāo)記在牡丹中的應(yīng)用參考文獻(xiàn)